vidjil issueshttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues2022-06-20T10:10:27+02:00https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1359export html: transformation en .pdf par le serveur2022-06-20T10:10:27+02:00Vidjil Teamexport html: transformation en .pdf par le serveurPriorité basse, à voir même si c'est utile
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@nobodyPriorité basse, à voir même si c'est utile
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@nobodyhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1328Que devrait indiquer le menu "analysis" tout comme les #visu.axis_select pour...2021-07-09T18:28:38+02:00Vidjil TeamQue devrait indiquer le menu "analysis" tout comme les #visu.axis_select pour des systèmes bizarres ?Quand on sélectionne TRD+, cela peut faire bizarre de voir les menus & co raconter "gene V" / "gene J". On pourrait avoir "gene V+D2" et "gene J+D3". En fait cela dépend des données : s'il y a beaucoup de V (plus le D2) cela passe, sinon...Quand on sélectionne TRD+, cela peut faire bizarre de voir les menus & co raconter "gene V" / "gene J". On pourrait avoir "gene V+D2" et "gene J+D3". En fait cela dépend des données : s'il y a beaucoup de V (plus le D2) cela passe, sinon cela fait bizarre.
Mais je ne vois pas de bonne solution, cela dépend de chaque germline bizzare (et afficher "5'" ne serait pas clair pour tout le monde). Bref, proposition : ne rien changer pour l'instant...
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@nobodyhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1326Stats sur clones sélectionnés : position2022-06-20T10:11:13+02:00Vidjil TeamStats sur clones sélectionnés : positionRéfléchir si la position est optimale. (Les autres quantités sont à gauche, pas à droite).
De plus, quand on est en :hover sur un clone, faut-il changer ou non le comportement des stats ?
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@nobodyRéfléchir si la position est optimale. (Les autres quantités sont à gauche, pas à droite).
De plus, quand on est en :hover sur un clone, faut-il changer ou non le comportement des stats ?
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@nobodyhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1291Nom de chaque sample : dans la DB ?2021-06-24T16:31:17+02:00Vidjil TeamNom de chaque sample : dans la DB ?Le nom de chaque sample se modifie dans la fenêtre principale (et s'enregistre par "save analysis"), alors que la date se modifie dans la DB. Ce n'est pas optimal. Surtout, quand on consulte la DB, on ne voit pas les noms des points dans...Le nom de chaque sample se modifie dans la fenêtre principale (et s'enregistre par "save analysis"), alors que la date se modifie dans la DB. Ce n'est pas optimal. Surtout, quand on consulte la DB, on ne voit pas les noms des points dans la liste des fichiers (qu'on a passé du temps à renommer, style "Diag-PCR2-BC10")
- Faut-il un champ de plus dans la DB "Sample name" ?
- Ou bien prendre "info" (mvouais, texte libre...) ?
- Ou au moins afficher le "Sample name" comme colonne dans la DB ?
(plus généralement, mécanisme infos DB <> infos analysis ?)
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Discussion plus radicale à avoir : y a-t-il encore besoin d'avoir des noms de samples ?
- pour la MRD, probablement non (date suffit, surtout si on peut mettre des événements)
- par contre, pour d'autres utilisations, c'est indispensable (souris, comparaisons de labos, ...)
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@Duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1283Normalisation pour le multi-système2023-06-28T18:04:26+02:00Vidjil TeamNormalisation pour le multi-systèmeSi on a plusieurs systèmes (ou, plus généralement, plusieurs PCRs)... on peut avoir plusieurs normalisations différentes :-(
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Sur Leu-multi, on dirait que le clone TRG principal normalisé (vs standard TRG) et le clone IGH normalisé (v...Si on a plusieurs systèmes (ou, plus généralement, plusieurs PCRs)... on peut avoir plusieurs normalisations différentes :-(
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Sur Leu-multi, on dirait que le clone TRG principal normalisé (vs standard TRG) et le clone IGH normalisé (vs standard IGH) sont d'ailleurs très proches, beaucoup plus que si on normalise tout de la même manière. Quelque part c'est une bonne nouvelle, cela montre l'intérêt de la normalisation.
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C'est rigolo, on en a donc parlé tout à l'heure.
Avant de coder, on en parlera, ce n'est pas si évident que cela et cela ajoutera peut-être trop de complexité.
Pour l'article, on fera à la main ou même, deux courbes à côté, ce sera plus lisible.
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On ne peut pas comparer les courbes des clones IGH et TRG, ce sont des % sur le total de reads segmentés.
Un clone IGH à 1% (1% des reads segmentés) sur le graphique peut tres bien représenter 50% des IGH ou seulement 2% suivant la proportion d'IGH dans les reads segmentés.
C'est ce qui se passe pour leu entre les timepoints 4 et 5, la proportion d'IGH chute
(console javascript >> `m.clusterBy(function(id){return m.clone(id).getSystem()});`)
Il faudrait un mode qui sépare chaque système et calcul la taille d'un clone en fonction des reads segmentés dans son système (mais ca veut dire qu l'on risque de voir des clones avec tres peu de reads se retrouver avec un % élevé si leurs systèmes sont peu ou pas segmentés (bref du bruit au milieux des clones patho ... ))2023-11-01https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1266Taille de fenêtre en IGH : cas où 50 ne suffit pas ?2018-11-20T09:18:26+01:00Vidjil TeamTaille de fenêtre en IGH : cas où 50 ne suffit pas ?La taille des fenêtres en multi-système est globale. À rajouter dans germlines et voir les implications dans windowExtractor ou la représentative.
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On remet donc le doigt dessus.
C'est embêtant si on est amené à comparer des données p...La taille des fenêtres en multi-système est globale. À rajouter dans germlines et voir les implications dans windowExtractor ou la représentative.
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On remet donc le doigt dessus.
C'est embêtant si on est amené à comparer des données produites par des configs différentes.
Au minimum : rajouter dans germline, pour qu'en multi IGH soit aussi à 60.
Ou sinon, grande homogénéisation, tout le monde à 40, 50, ou 60.
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On pourrait décider de cela avant 2015.02.
Je penche pour la grande homogénéisation.
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à décider pour 2015.02
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ok, on voit cela pour 2015.04
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plus tard...
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Au fait, j'ai bien vu hier que la propagande officielle indique "50" partout :)
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2d80348, 50 pour tout le monde.
Il n'y a "plus" que la transition server à voir, autre tâche.
***
Euh… c'est pas un peu dangereux de mettre ça sur master alors qu'on n'a pas de moyen de faire la transition ? Ça veut dire qu'il ne faut surtout pas changer la version de vidjil sur rbx
***
rbx est sur 2015.04, sur un version stable, oui il faudra faire attention à ne pas changer tout de suite... master sert à cela :)
***
au passage, master est désynchronisé avec rbx depuis déjà quelque temps , surtout avec le -e 1.0 par défaut mais aussi le -t 100
***
50bp, est-ce bien raisonnable ? Oui je sais on n'a plus ou moins tranché mais sans vraiment avoir de recul sur des données.
Mais quand je vois ça : http://rbx.vidjil.org/browser/?patient=481&config=26 (clone à 1,5% et afficher la fenêtre), si le D était un peu plus grand ou moins grignoté, ça fait un peu peur…
***
Par contre un exemple qui fait très peur, sur le même jeu de données, c'est le clone à 0,671% : on a du D, du J et un seul nucléotide dans le N.
***
Dans ce cas on pourrait passer à 60... mais cela ne fait que 5 de plus de cahque côté, on va toujours avoir des cas limite même à 60.
***
Mmmm…. on a déjà eu du mal à prendre cette décision 50 (n’oublions pas que c’est 40 en ce moment). Par contre, on pourrait imaginer un process qui met un warning sur certains clones. En sortie du FineSegmenter, on devrait savoir si on est dans un cas limite ou non.
Et ce problème est (dans certains cas) indépendant de la taille de la fenêtre : Si on a un V/J collé avec 0 zone de N, ce sera très limite même avec une fenêtre de taille 100 :-) On doit mettre un gros warning dessus, et permettre de revenir sur les reads.
***
N'oublions pas que c'est 60 en IGH pour l'instant… (4^5 = 1024).
Ce sont des cas que j'ai vus sans trop chercher, parmi les 100 clones du jeu de données que j'avais en face de moi. C'est ça qui fait peur. Évidemment il y aura toujours des cas limites, mais là je n'ai pas épluché tous nos résultats avec de l'IGH pour tomber sur LE cas limite.
***
Exemple 0481 mis dans notable.
Pour cet exemple, on est finalement sauvé (euh ? une délétion au troisième nucl de J) par ce que voit IMGT.
Mais cela n'enlève pas le problème, on doit alerter si faible spécificité de la fenêtre (tâche dédiée).
Être à 60 permet d'avoir 4^5... si on récupère bien du N sur un des côtés, ce qui est loin d'être sûr.
Maintenant, reste la question du -w par défaut.
Les utilisateurs en multi doivent avoir la même qualité que ceux en IGH seul, et la qualité doit être au top pour tout le monde.
On teste le -w 50 depuis longtemps en multi... et... les tests passent.
***
Revu une trentaine de clones des utilisateurs IGH (Florian, Eva, Jack). Aucun soucis pour le -w 50. Mais plusieurs soucis pour certaines spécificités avec zéro N qu'un -w 60 ne résoud pas.
Tranché, c'est douloureux. Je maintiens "The default value (=-w 50=) was selected to ensure a high-quality clone gathering."
Mise en prod server : si on hésite (non, il ne faut pas...), on pourra mettre -w 60 pour la config IGH.
Tâche renommé, le pb est IGH.
***
La nouvelle tâche S22 m'a fait encore plus peur... mais on est bien sur autre chose que les discussions 50/60.
***
(sur rbx, IGH est encore en -w 60, tout le reste en -w 50 par défaut, sauf les configs [old])
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@magiraud @mikael-shttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1264Réuploader un fichier garde le nom d'origine2017-01-05T10:06:49+01:00Vidjil TeamRéuploader un fichier garde le nom d'origineLorsqu'on réuploade un fichier pour remplacer un mauvais fichier par le bon, le nom n'est pas modifié. Ça se discute, mais est-ce réellement souhaitable : j'uploade un fichier toto.fastq mais je conserve le nom tata.fastq, qui était le n...Lorsqu'on réuploade un fichier pour remplacer un mauvais fichier par le bon, le nom n'est pas modifié. Ça se discute, mais est-ce réellement souhaitable : j'uploade un fichier toto.fastq mais je conserve le nom tata.fastq, qui était le nom du fichier uploadé à l'origine. Cela peut être déroutant.
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@nobodyhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1253Se souvenir des amorces/primers utilisées : comment ?2023-03-28T16:11:50+02:00Vidjil TeamSe souvenir des amorces/primers utilisées : comment ?On pourrait gérer plus proprement les amorces, avec
- des listes d'amorces (Biomed ? nouvelles EC ? d'autres ?)
- en fonction des amorces sélectionnées, les confisg (ou les stats) sont différents, ou d'autres features
- et certains...On pourrait gérer plus proprement les amorces, avec
- des listes d'amorces (Biomed ? nouvelles EC ? d'autres ?)
- en fonction des amorces sélectionnées, les confisg (ou les stats) sont différents, ou d'autres features
- et certains réglages permettraient de chosir directement un "kit" d'amorces
Ce n'est pas facile, que cela soit au niveau de la db, du browser derrière, et même de la conception / de ce qu'on veut. Vraiment pas la priorité pour l'instant.
***
mis dans la demande d'ADT, 2016Web 2023.10https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1236germlines.js: mise à jour des séquences2017-12-04T14:55:54+01:00Vidjil Teamgermlines.js: mise à jour des séquencesMarc, tu as un script quelque part qui crée le .js ? Il faudrait le relancer... (et le mettre dans le git, à côté de split-from-imgt.py). Note qu'il y a maintenant des fichiers isolés (type TRDD2-01.fa, et il y aura aussi KDE.fa), certai...Marc, tu as un script quelque part qui crée le .js ? Il faudrait le relancer... (et le mettre dans le git, à côté de split-from-imgt.py). Note qu'il y a maintenant des fichiers isolés (type TRDD2-01.fa, et il y aura aussi KDE.fa), certaines séquences peuvent être en double.
Ou bien, à terme, faire que le javascript accède directement aux séquences dans les fichiers fasta dans germline (et dans ce cas, plus besoin de js/germline.js vu que le reste est dans germline.data)
***
>>faire que le javascript accède directement aux séquences dans les fichiers fasta dans germline
On peut parser n'importe quel fichier texte en javascript sauf les fichiers locaux (toujours la même restriction le javascript n'a pas a accéder aux fichiers de l'utilisateur) donc faisable mais il faut abandonner le offline
***
donc pour l'instant le germline.js est une bonne solution (pas parfaite, mais bon)
***
séquences a jour ainsi que le script déplacé dans /germline
>> 41b25020ac88a0
>> 948fead4f8d6fec
***
e4d33ac : script rajouté dans get-germline
***
@Duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1229N, autres nucléotides étendus2020-02-21T21:20:02+01:00Vidjil TeamN, autres nucléotides étenduscore/tools.cpp:complement_nucleotide(66-76) pourrait faire croire que l'on gère d'autres nucléotides que A, C, G, T. Il n'en est évidemment rien :
- KmerStore::get() ne renvoie qu'un seul kmer
- et même dans dynprog, Cost::substitution...core/tools.cpp:complement_nucleotide(66-76) pourrait faire croire que l'on gère d'autres nucléotides que A, C, G, T. Il n'en est évidemment rien :
- KmerStore::get() ne renvoie qu'un seul kmer
- et même dans dynprog, Cost::substitution fait seulement (a == b)
Si on y tient :
- autoriser des caractères étendus dans les reads > trop complexe à gérer, risque de ralentir
(****mais que se passe t-il actuellement ? si N ? il faudrait être clair***)
- autoriser des caractères étendus dans les germlines > pas plus simple, mais pour le coup cela ne ralentirait pas
Bofbof. Utiilité ?
***
- en sortie : voir "representative"
***
l'automate rendrait certaines choses possibles (en le faisant grossir, certes)
***
@magiraud @mikael-shttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1227Trouver des raccourcis claviers utiles, quelles touches ?2023-06-29T14:45:38+02:00Vidjil TeamTrouver des raccourcis claviers utiles, quelles touches ?Plus généralement, trouver d'autres raccourcis claviers utiles.
- Les flèches haut/bas pourraient se ballader dans les clones (par abondance en fonction du point ?)
- tab ?
- autres fonctions ?
Celui qui veut peut proposer...
***
C'...Plus généralement, trouver d'autres raccourcis claviers utiles.
- Les flèches haut/bas pourraient se ballader dans les clones (par abondance en fonction du point ?)
- tab ?
- autres fonctions ?
Celui qui veut peut proposer...
***
C'était aussi une question de Yann : est-ce qu'on peut utiliser le clavier ?
Typiquement Ctrl+S pour enregistrer le fichier d'analyse, Ctrl+E (par ex.) pour exporter en PDF. On pourrait avoir des raccourcis pour changer de vue analysis.
Ctrl+1, Ctrl+2, etc pour aller au patient 1, 2, etc dans les derniers patients du menu patients
***
Pomme-S, tu veux dire ? Je sors.
***
Raccourci pour normaliser : Ctrl+N (bof). Il peut y avoir plusieurs normalisations : un raccourci par normalisation ou cycle ?
***
Normalisation : si pas Ctrl-N, Ctrl-Z ou je ne sais pas quoi.
On cycle entre les différentes normalisations s'il y en a plusieurs.
***
Ce n'est pas évident de trouver des touches disponibles.
Voir http://webmasters.stackexchange.com/questions/18041/best-modifier-key-combination-for-web-shortcuts
Une solution est de se limiter à des lettres simples. Mais chez nous, lettre simple = choix de système.
On pourrait avoir Shift-N & co.
***
@nobodyhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1203Fichiers compressés pour le c++2016-11-29T14:33:08+01:00Vidjil TeamFichiers compressés pour le c++Proposition pour faire simple : si un fichier est en .gz / .zip / .bz2, au moment où il est sauvegardé, on le décompresse.
(En fait ce n'est pas si simple, cela demande de vérifier qu'il ne fait bien qu'un seul fichier et qu'il ne va p...Proposition pour faire simple : si un fichier est en .gz / .zip / .bz2, au moment où il est sauvegardé, on le décompresse.
(En fait ce n'est pas si simple, cela demande de vérifier qu'il ne fait bien qu'un seul fichier et qu'il ne va pas pourrir le répertoire d'upload : est-ce que cela peut être vérifié)
(On pourrait ensuite réfléchir à une compression du reste et à tout sauvegarder, mais ce n'est pas urgent du tout.)
***
Bingo : Salamanca nous a envoyé deux fichiers en .gz.
Ce que j'ai fait, à la main : décompresser (dans /mnt/upload/uploads), puis un lien symbolique
ln -s xxxxx.fa xxxxx.fa.gz (la DB croit toujours que le fichier s'appelle .gz)
***
Rebelote, nouvel envoi de Salamanca
3a44cbc16e, gunzip-sequences.py, à lancer par www-data.
Quelle sera la bonne solution ? à discuter :
- soit le serveur lance gunzip-sequences.py
- ou bien décompression de chaque fichier
- soit traité par vidjil.cpp ?
***
se linker à <zlib.h> (optionnel, avec #ifdef)
***
gzstream : http://www.cs.unc.edu/Research/compgeom/gzstream/
***
header-only version of gstream : https://gist.github.com/piti118/1508048
peut-être trop confidentiel ?
***
27e8474..ef122da
***
@magiraud @mikael-shttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1197Coding practise: qu'a-t-on le droit de mettre dans views/ ?2021-06-24T16:18:41+02:00Vidjil TeamCoding practise: qu'a-t-on le droit de mettre dans views/ ?479944e et autres :
- doit-on mettre de tels bouts de codes dans views/...
- ou faut-il plutôt définir des controlleurs/vues adaptées quelque part (en python), puis les appeler dans views ?
***
le gros defaut des vues pour le moment c...479944e et autres :
- doit-on mettre de tels bouts de codes dans views/...
- ou faut-il plutôt définir des controlleurs/vues adaptées quelque part (en python), puis les appeler dans views ?
***
le gros defaut des vues pour le moment c'est qu'elles font une requete sql, ca doit etre remis dans les controlleurs.
autre chose, l'utilisation des raccourcis web2py comme "hasPermission(...)" qui pourrait etre inclus dans la requete et repassé au controlleur (même si ça risque de faire des requetes de 12 étages).
la vue n'a pas a appeler de fonction du controlleur, elle est censé recevoir les infos qu'elle doit mettre en forme des le départ
***
Le pire dans les vue c'est qu'on se rend parfois difficilement compte qu'on est en train d'implémenter une boucle. On a parfois des vérifications de permissions dans des boucles, donc ça revient souvent à une requête par itération.
***
@RyanHerb @Duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1188API / URL persistantes : réfléchir à d'autres services utiles2020-11-20T21:11:37+01:00Vidjil TeamAPI / URL persistantes : réfléchir à d'autres services utiles- se logguer directement avec un token
- se logguer directement + ouvrir un patient ?
- se logguer directement (admin) + page monitor
***
- fuse.py + affichage ?
- align.cgi ?
***
Export
- `&export=html` (ou `pdf`)
...- se logguer directement avec un token
- se logguer directement + ouvrir un patient ?
- se logguer directement (admin) + page monitor
***
- fuse.py + affichage ?
- align.cgi ?
***
Export
- `&export=html` (ou `pdf`)
- `fasta` ? `svg` ?
- `igblast` ? `vquest` ?
***
Préférences utilisateurs (#878)
- tout ce qui est dans le menu "settings"
***
Sélection en cours
- "color by" et locus selectionnés
- graph : sample sélectionné
- `?plot=5` ou `?plot=gene_v,gene_v` ? : mode et axes sélectionnés
- `?clones=4,6,35` -> sélectionne des clones
- voire même search et/ou focus !
`?search=ACATCT`, `?focus=ACATCT` ?
***
***
@RyanHerb @mikael-s @aurelBZH
https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1185Distribution/histogramme des longueurs des séquences segmentées (ou non)2017-03-11T07:08:35+01:00Vidjil TeamDistribution/histogramme des longueurs des séquences segmentées (ou non)On pourrait un jour étendre core/stats.cpp pour stocker la distribution des reads (attention à ce que ne cela ralentisse pas l'algo), puis afficher cette distribution dans le browser
***
déjà fait
***
@magiraud @DuezOn pourrait un jour étendre core/stats.cpp pour stocker la distribution des reads (attention à ce que ne cela ralentisse pas l'algo), puis afficher cette distribution dans le browser
***
déjà fait
***
@magiraud @Duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1148Exporter un .fastq pour la représentative / qualité pour la consensus (ensemb...2023-10-19T14:40:36+02:00Vidjil TeamExporter un .fastq pour la représentative / qualité pour la consensus (ensemble de la séquence)et/ou utiliser des N voire autres caractères
***
Mikaël: "ad60c833 est un bon début"
***
Discussion en audio du 11 décembre.
L'objet Fasta se souvient de la qualité. La représentative se souvient des 1000 plus longs. On pourrait déjà fa...et/ou utiliser des N voire autres caractères
***
Mikaël: "ad60c833 est un bon début"
***
Discussion en audio du 11 décembre.
L'objet Fasta se souvient de la qualité. La représentative se souvient des 1000 plus longs. On pourrait déjà faire qualité moyenne sur fenêtre (les 1000 plus longs, voire tout).
Faire sur toute la séquence : plus complexe, comment combiner qualité + nombre des séquences ? Peut-être c'est plus informatif (et simple) de montrer le coverage par base (attention, approximatif car k-mers).
***
Discuté au VW16.
***
Marc a fait cela pour la fenêtre (branche windows_quality)
***
mergé pour la fenêtre
***
@mikael-shttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1100Undo / Pouvoir retracer toutes les actions2021-10-21T19:11:45+02:00Vidjil TeamUndo / Pouvoir retracer toutes les actionsTracabilité / Révocabilité.
On peut vouloir tout tracer (savoir que tel clinicien a modifié le fichier .analysis)... ou, pire, vouloir revenir en arrière (très très dur là).
À discuter un jour, absolument non prioritaire pour le moment...Tracabilité / Révocabilité.
On peut vouloir tout tracer (savoir que tel clinicien a modifié le fichier .analysis)... ou, pire, vouloir revenir en arrière (très très dur là).
À discuter un jour, absolument non prioritaire pour le moment.
***
Évoqué avec Yann et Lille. Sans aller jusqu'au undo, la tracabilité complète sera bientôt à l'ordre du jour...
***
Mis comme projet étudiant, sinon Ryan en 2016 ?
***
http://www.vidjil.org//projet-tracabilite.html
Pas de candidat pour l'instant
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@nobodyhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1098Expiration des fichiers .fasta2017-11-22T12:48:32+01:00Vidjil TeamExpiration des fichiers .fastaAu bout d'un moment, on pourrait supprimer des fichiers.
(Cela ne choquait pas Martin qu'on ne garde pas tout)
Peut-être en prévenant par mail avant les utilisateurs.
***
6857522
***
@DuezAu bout d'un moment, on pourrait supprimer des fichiers.
(Cela ne choquait pas Martin qu'on ne garde pas tout)
Peut-être en prévenant par mail avant les utilisateurs.
***
6857522
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@Duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1077Quelles versions de navigateur demande-t-on a nos usagers ?2021-11-11T10:39:32+01:00Vidjil TeamQuelles versions de navigateur demande-t-on a nos usagers ?
**Ici ~"!-reflexion", voir les stats sur #2417.**
***
* IE : ne passe pas sur IE 9.0 (cf mails avec Jos), pourtant 2011 :-). Passe avec IE 10.0 ?
* IE : il semble que cela passe sur IE 10.0
***
rempli browser.org, mais avec des versi...
**Ici ~"!-reflexion", voir les stats sur #2417.**
***
* IE : ne passe pas sur IE 9.0 (cf mails avec Jos), pourtant 2011 :-). Passe avec IE 10.0 ?
* IE : il semble que cela passe sur IE 10.0
***
rempli browser.org, mais avec des versions blindées actuelles... il faudrait enquêter plus pour donner des versions plus raisonnables (et aussi vérifier pour IE 10)
***
Il faudrait une URL publique sans authentification pour lancer des « tests » (basiques) en utilisant des sites comme http://browsershots.org/ ou http://www.browserstack.com
Sur rbx on pourrait même utiliser le paramètre ?data pour tester la visualisation de http://rbx.vidjil.org/browser/?data=test.vidjil sur plein de navigateurs. Bien sûr il faudrait désactiver la vérification du navigateur pour ces tests (avec un param dans l'URL ?).
Ou alors on peut interagir directement avec browserling.com (mais ça demande pas mal de temps).
***
Excellente idée...
et c'est déjà le cas : http://rbx.vidjil.org/browser/?data=test.vidjil ne demande pas d'authentification
Essayé sur browsershots.org, mais n'arrive pas à lire robots.txt (alors que j'en ai rajouté un dans sites-available)
***
browserling, je ne connaissais pas. Rigolo, et il faut se dépécher en 3 minutes :)
***
Yououh ! http://browsershots.org/http://rbx.vidjil.org/browser/?data=test.vidjil
(robots: c'était peut-être juste un problème de cache.)
***
FF: le 21 a l'air de marcher... mais d'autres (22, 27, 28, 31) ne sont pas passés (pb juste temporaire ?)
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Chrome: à partir du 20, cela a l'air correct (mais boites de bug dans plusieurs versions ensuite) ?
***
Bizarre pour FF, sur browserling j'avais pu jouer avec FF4 et ça marchait bien.
***
Obtenir d'anciennes versions de Chrome : https://google-chrome.en.uptodown.com/ubuntu/old
(si qq1 connait une astuce pour avoir plusieurs versions en parallèle, je suis preneur).
***
J'ai trouvé ça: http://stackoverflow.com/questions/10541225/cross-browser-testing-all-major-browsers-on-one-machine#10541484 mais je n'ai pas encore testé
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#1078, #1079, #1080
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@RyanHerb @Duez @mikael-s @aurelBZHWeb 2018.01https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1048Stats sur le jeu complet dans le fichier .vidjil / smaller clones2019-10-29T14:38:34+01:00Vidjil TeamStats sur le jeu complet dans le fichier .vidjil / smaller clonesReparlé plusieurs fois lors des dernières semaines.
Quels stats seraient intéressantes, sur tous les clones (pas seulement les FineSegmentés) ? Distribution des longueurs (on l'a, mais un peu brut), autres ?
(distribution V/J/CDR3/... de...Reparlé plusieurs fois lors des dernières semaines.
Quels stats seraient intéressantes, sur tous les clones (pas seulement les FineSegmentés) ? Distribution des longueurs (on l'a, mais un peu brut), autres ?
(distribution V/J/CDR3/... demanderait de faire plus de FineSegmenter)
***
@nobody