vidjil issueshttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues2017-10-13T12:43:02+02:00https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2531Lorsque finalement on n'ajoute pas de nouvelle vue2017-10-13T12:43:02+02:00Mathieu GiraudLorsque finalement on n'ajoute pas de nouvelle vueRe-clic sur le numéro de la vue (voire mêem sur le menu), il ne se passe rien.Re-clic sur le numéro de la vue (voire mêem sur le menu), il ne se passe rien.https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2530Geste pour l'édition des vues2020-06-23T09:35:05+02:00Mathieu GiraudGeste pour l'édition des vuesPour l'instant double clic (#2529).
On verra plus tard quel sera le geste exact: appui long ? drag/drop ? clic+shift ? et sur tablette/mobile ?Pour l'instant double clic (#2529).
On verra plus tard quel sera le geste exact: appui long ? drag/drop ? clic+shift ? et sur tablette/mobile ?https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2529Simple clic : une vue à sa bonne place2017-10-13T12:43:02+02:00Mathieu GiraudSimple clic : une vue à sa bonne placeDans le panel par défaut, ou sinon dans le dernier panel mis.Dans le panel par défaut, ou sinon dans le dernier panel mis.https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2527Suppression de vue2017-10-13T12:43:02+02:00Mathieu GiraudSuppression de vuePeut-être afficher une croix/poubelle lorsqu'on est en édition de vues
@heto: quand on affiche les overlays, quelque chose en bas du menuPeut-être afficher une croix/poubelle lorsqu'on est en édition de vues
@heto: quand on affiche les overlays, quelque chose en bas du menuhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2514Que devient l'auto-expansion du segmenteur en responsive ?2017-06-07T13:44:43+02:00Mathieu GiraudQue devient l'auto-expansion du segmenteur en responsive ?Discuté avec @heto et @mikael-s tout à l'heure. À revoir après #2500 / #1740 : utiliser tel quel le même mécanisme, le recoder si besoin, utiliser quelque chose de plus générique qui pourrait aussi concerner d'autres vues ?Discuté avec @heto et @mikael-s tout à l'heure. À revoir après #2500 / #1740 : utiliser tel quel le même mécanisme, le recoder si besoin, utiliser quelque chose de plus générique qui pourrait aussi concerner d'autres vues ?https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2509Aligneur : paramétrer pour que les alignements soient jolis2023-01-25T09:41:58+01:00Mathieu GiraudAligneur : paramétrer pour que les alignements soient jolisSuite à #2501, mieux paramétrer pour que l'alignement soit joli. Pas urgent.
cc @aurelBZHSuite à #2501, mieux paramétrer pour que l'alignement soit joli. Pas urgent.
cc @aurelBZHhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2506Pas assez de clones pour des études de répertoire2019-04-08T13:24:29+02:00Mathieu GiraudPas assez de clones pour des études de répertoireK. Tarte de ~"REN-Rennes", sur des jeux de TRB, trouve qu'il n'y a pas assez de clones pour étudier la diversité et l'overlap entre des répertoires.
cc @flothoni
Pour une fois ce n'est pas #1382 (car ici un seul locus), mais #2236, ou ...K. Tarte de ~"REN-Rennes", sur des jeux de TRB, trouve qu'il n'y a pas assez de clones pour étudier la diversité et l'overlap entre des répertoires.
cc @flothoni
Pour une fois ce n'est pas #1382 (car ici un seul locus), mais #2236, ou des choses sur ~"server-fuse".https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2499Lignes des axes noires/grises2018-08-09T14:28:40+02:00Mathieu GiraudLignes des axes noires/grises> Bonjour,
>
> J’ai vu qu’hier vous avez effectué une maintenance et je ne sais pas si c’est en lien ou non mais je trouve que les lignes du graphe sont bizarres, grises ou noires. Est-ce lié ? Cela n’empêche évidemment pas l’analyse...> Bonjour,
>
> J’ai vu qu’hier vous avez effectué une maintenance et je ne sais pas si c’est en lien ou non mais je trouve que les lignes du graphe sont bizarres, grises ou noires. Est-ce lié ? Cela n’empêche évidemment pas l’analyse, ce n’est qu’esthétique J !
>
> Aurélie
cc @flothoniThonier FlorianThonier Florianhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2494La liste des fichiers pour un compare patients/sets met trop de temps à s'aff...2018-04-13T12:36:06+02:00Ryan HerbertLa liste des fichiers pour un compare patients/sets met trop de temps à s'afficher.Lorsqu'on veut faire un compare patients/sets en tant qu'admin, il y a vraiment beaucoup de données à traiter (et actuellement prend environ 60s).
Il est donc très facile de saturer les threads du serveur car on a l'impression que rien n...Lorsqu'on veut faire un compare patients/sets en tant qu'admin, il y a vraiment beaucoup de données à traiter (et actuellement prend environ 60s).
Il est donc très facile de saturer les threads du serveur car on a l'impression que rien ne se passe alors que le thread lui n'est pas libéré au bout de 10s comme l'est le browser.
cc @flothoniRyan HerbertRyan Herberthttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2491Segmenter : ordre des germlines/séquences2021-11-26T11:42:12+01:00Mathieu GiraudSegmenter : ordre des germlines/séquencesRemarque de @aurelBZH : dans quel ordre ?
Actuellement clones + tous les germlines.
Peut-être les V + clones + les J ? Les V/J autour de chaque clone ? Comment fait-on pour les clones qui partagent un même V/J ?
Remarque de @RyanHerb ...Remarque de @aurelBZH : dans quel ordre ?
Actuellement clones + tous les germlines.
Peut-être les V + clones + les J ? Les V/J autour de chaque clone ? Comment fait-on pour les clones qui partagent un même V/J ?
Remarque de @RyanHerb : une possibilité serait `.insertAfter` en prenant l'id du clone.
À voir plus tard, rien d'urgent.
cc @aurelBZH @RyanHerb @hetohttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2489Initialiser la position des germlines V/D/J au bon endroit approximatif2020-08-04T09:28:11+02:00Mathieu GiraudInitialiser la position des germlines V/D/J au bon endroit approximatifcc @RyanHerbcc @RyanHerbhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2486Supprimer les fichiers fused si aucun résultat n'existe plus avec cette config2018-07-12T10:10:36+02:00Mikaël SalsonSupprimer les fichiers fused si aucun résultat n'existe plus avec cette configSuite à !49 (et #2478 ainsi que #1631) les fichiers fused sont bien mis à jour après suppression des résultats. En revanche les liens vers les visualisations (sur la liste des samples sets ou au sein d'un sample set) restent même s'il n'...Suite à !49 (et #2478 ainsi que #1631) les fichiers fused sont bien mis à jour après suppression des résultats. En revanche les liens vers les visualisations (sur la liste des samples sets ou au sein d'un sample set) restent même s'il n'y a plus de fichier résultat avec cette config.
Cela signifierait supprimer les fichiers fused correspondant, j'imagine (ce que l'on ne fait pas pour l'instant).
Ce n'est pas critique : cela ne provoque pas d'erreur et la visualisation des résultats indique bien que le fichier a été supprimé.https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2484Donner accès aux fichiers dans des sous-répertoires du répertoire temporaire2017-11-29T13:54:40+01:00Mathieu GiraudDonner accès aux fichiers dans des sous-répertoires du répertoire temporaireSuite à #2141, j'ai l'impression qu'on ne peut pas donner accès aux fichiers dans des sous-répertoires (typiquement le répertoire `out/seq` de Vidjil). Le problème si l'on met tout cela à plat est qu'on peut avoir beaucoup de fichiers......Suite à #2141, j'ai l'impression qu'on ne peut pas donner accès aux fichiers dans des sous-répertoires (typiquement le répertoire `out/seq` de Vidjil). Le problème si l'on met tout cela à plat est qu'on peut avoir beaucoup de fichiers...
à voir si cela vaut le coup (notamment pour #1703), mais rien d'urgent
cc @RyanHerbhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2483Mettre à disposition les reads non-segmentés2021-11-23T16:49:46+01:00Mathieu GiraudMettre à disposition les reads non-segmentésSuite à #1671 (fermée), souhaite-t-on avoir d'autres configs pour rendre disponibles d'autres fichiers ?
À voir si ~"user-request".Suite à #1671 (fermée), souhaite-t-on avoir d'autres configs pour rendre disponibles d'autres fichiers ?
À voir si ~"user-request".https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2479Mettre un verrou tant que des fichiers sont en cours de run/upload pour ne pa...2021-11-26T11:38:50+01:00Mikaël SalsonMettre un verrou tant que des fichiers sont en cours de run/upload pour ne pas lancer fuse ?Comme l'illustre #2472 : on lance beaucoup fuse.py, et inutilement.
@RyanHerb se demande si on ne pourrait pas poser un verrou pour ne pas lancer fuse tant que des fichiers sont encore en train d'être analysés (voire en cours d'upload)....Comme l'illustre #2472 : on lance beaucoup fuse.py, et inutilement.
@RyanHerb se demande si on ne pourrait pas poser un verrou pour ne pas lancer fuse tant que des fichiers sont encore en train d'être analysés (voire en cours d'upload). Cela permettrait de ne lancer qu'un seul fuse, une bonne fois pour toute plutôt que de lancer un fuse à la suite de chaque lancement (c'est aussi une réponse possible à #2011).
Inconvénient : on ne peut pas commencer à voir des résultats partiels.https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2474Non affichage des svg dans les boutons bar/plot du menu scatterplot2018-04-09T20:09:58+02:00Ghost UserNon affichage des svg dans les boutons bar/plot du menu scatterplotProblème détecté l'autre jour avec @magiraud après les premières modifications pour #2244.
Le problème n'est finalement pas lié à cette issue comme supposé, je viens de m'apercevoir qu'il est également présent sur dev.
Voilà ce que...Problème détecté l'autre jour avec @magiraud après les premières modifications pour #2244.
Le problème n'est finalement pas lié à cette issue comme supposé, je viens de m'apercevoir qu'il est également présent sur dev.
Voilà ce que donne la console :
```
XMLHttpRequest cannot load file:///.../vidjil/browser/images/bar.svg. Cross origin requests are only supported for protocol schemes: http, data, chrome, chrome-extension, https.
```
Et même chose pour `plot.svg`.
A régler pour la release de lundi je suppose
cc @mikael-s @RyanHerb https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2464Dead code scatterPlot.js, retirer les mention active_move2022-06-21T13:22:16+02:00Mathieu GiraudDead code scatterPlot.js, retirer les mention active_moveUniquement si `sp.reinit` (qui ne devrait pas arriver ?)
Le retirer ?Uniquement si `sp.reinit` (qui ne devrait pas arriver ?)
Le retirer ?https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2450Scatterplot responsive : adapter l'axe et le nombre de labels2018-10-16T09:58:29+02:00Mathieu GiraudScatterplot responsive : adapter l'axe et le nombre de labelsQuand on a peu de place en largeur, on devrait afficher moins de labels.
Voir aussi #2421.
cc @heto @RyanHerbQuand on a peu de place en largeur, on devrait afficher moins de labels.
Voir aussi #2421.
cc @heto @RyanHerbhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2449construction des objets germlines2017-08-30T09:02:51+02:00Ghost Userconstruction des objets germlinescomment les objets germlines doivent ils etre construit? quel germline doivent etre incluses dans chaque objet?comment les objets germlines doivent ils etre construit? quel germline doivent etre incluses dans chaque objet?https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2448Utiliser e.key pour les raccourcis claviers2022-12-14T18:18:40+01:00Mathieu GiraudUtiliser e.key pour les raccourcis claviersEn étant sur #1227, je me rends compte que l'utilisation de `e.which` ne permet pas facilement d'avoir des valeurs portables, typiquement pour `#` et pour `+`. Utiliser `e.which` est deprecated selon https://developer.mozilla.org/en-US/...En étant sur #1227, je me rends compte que l'utilisation de `e.which` ne permet pas facilement d'avoir des valeurs portables, typiquement pour `#` et pour `+`. Utiliser `e.which` est deprecated selon https://developer.mozilla.org/en-US/docs/Web/API/KeyboardEvent/key).
Une solution serait de passer à `e.key`, qui fonctionne au moins pour les navigateurs récents, et qui semble bien plus portable et propre :
https://developer.mozilla.org/en-US/docs/Web/API/KeyboardEvent/key