vidjil issueshttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues2016-11-29T14:32:00+01:00https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1117Voir nom du patient (et date de naissance, config) en haut du div.#info2016-11-29T14:32:00+01:00Vidjil TeamVoir nom du patient (et date de naissance, config) en haut du div.#infoOn ne sait plus sur qui on travaille quand on est sorti du dialogue BD :)
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On ne voit plus le nom actuellement
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Pour certains fichiers, on ne l'a plus. Par exemple Mickey Mouse sur rbx.
Dans ces cas, m.dataFileName est vide. Est-ce...On ne sait plus sur qui on travaille quand on est sorti du dialogue BD :)
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On ne voit plus le nom actuellement
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Pour certains fichiers, on ne l'a plus. Par exemple Mickey Mouse sur rbx.
Dans ces cas, m.dataFileName est vide. Est-ce parce qu'il n'y a pas eu d'.analysis sauvegardé ?
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>>Dans ces cas, m.dataFileName est vide. Est-ce parce qu'il n'y a pas eu d'.analysis sauvegardé ?
un probleme a cause du fichier analysis par defaut qui était malformé (la db renvoie toujours un .analysis)
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@Duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1118Méga-test fonctionnel, cohérence entre plusieurs "runs" à des mois d'intervalle2016-11-29T14:32:05+01:00Vidjil TeamMéga-test fonctionnel, cohérence entre plusieurs "runs" à des mois d'intervalleJuste des réflexions, on en parlera un jour ensemble.
Lors d'une évolution de vidjil/algo, serait-ce intéressant de comparer sur *tous* les fichiers de la database que les résultats sont toujours bons ?
Ou bien lorsque l'admin ferait "...Juste des réflexions, on en parlera un jour ensemble.
Lors d'une évolution de vidjil/algo, serait-ce intéressant de comparer sur *tous* les fichiers de la database que les résultats sont toujours bons ?
Ou bien lorsque l'admin ferait "relance all" ?
Autre manière de voir la chose : si un utilisateur fait "run" et qu'on a amélioré/changé le cpp, il ne trouve pas forcément la même chose. C'est voulu / documenté / warning ? Peut-il revenir en arrière s'il n'est pas content ?
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Marc, merci de regarder rapidement cela, tu nous disais mercredi dernier que c'était facile de ne pas supprimer les anciens runs... J'en ai besoin pour relancer sur rbx avec la nouvelle version
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e8b0805 compare-last-results.py
pour l'instant lancement manuel, on verra comment on améliorera cela ensuite
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#1119, #1120, #1121
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@magiraudhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1119Marc: ne pas supprimer les anciens runs2016-11-29T14:32:05+01:00Vidjil TeamMarc: ne pas supprimer les anciens runs
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#1118
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#1118https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1120Marc: faire un fichier python qui itère sur les couples de fichiers (old, new)2016-11-29T14:32:05+01:00Vidjil TeamMarc: faire un fichier python qui itère sur les couples de fichiers (old, new)
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#1118
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#1118https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1121Mathieu: compléter ce fichier avec un diff2016-11-29T14:32:05+01:00Vidjil TeamMathieu: compléter ce fichier avec un diff
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#1118
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#1118https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1122Accès pour Necker sur le serveur, diagnostic multi-systèmes2016-11-29T14:32:06+01:00Vidjil TeamAccès pour Necker sur le serveur, diagnostic multi-systèmesNecker veut passer en routine au diagnostic multi-système avec Vidjil.
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@magiraud @mikael-sNecker veut passer en routine au diagnostic multi-système avec Vidjil.
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@magiraud @mikael-shttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1123Diagnostic multi-systèmes2016-11-29T14:32:10+01:00Vidjil TeamDiagnostic multi-systèmesQue ce soit à Lille ou à Necker, la première application en routine de Vidjil va être probablement sur le diagnostic.
Même sans attendre l'"Algo multi-systèmes", on peut déjà avoir quelque chose pour nos collègues.
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On va dire que c'e...Que ce soit à Lille ou à Necker, la première application en routine de Vidjil va être probablement sur le diagnostic.
Même sans attendre l'"Algo multi-systèmes", on peut déjà avoir quelque chose pour nos collègues.
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On va dire que c'est bon, des tâches plus précises sont là pour les différents points
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#1124, #1125, #1126
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@Duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1124Visualisation (presque bon)2016-11-29T14:32:10+01:00Vidjil TeamVisualisation (presque bon)
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#1123
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#1123https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1125Algo (non, attente) (mais si, -g fonctionne...)2016-11-29T14:32:10+01:00Vidjil TeamAlgo (non, attente) (mais si, -g fonctionne...)
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#1123
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#1123https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1126Database (+ lancement ?)2016-11-29T14:32:10+01:00Vidjil TeamDatabase (+ lancement ?)
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#1123
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#1123https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1127Erreur 404 propre2017-11-22T12:48:31+01:00Vidjil TeamErreur 404 proprehttp://rbx.vidjil.org/bidule produit une invalid request → 404
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Si j'étais pointilleux je dirais que les erreurs 400 invalid request (controlleur inconnu) et 404 (page inconnu) sont différentes mais je ne le suis pas donc toutes les e...http://rbx.vidjil.org/bidule produit une invalid request → 404
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Si j'étais pointilleux je dirais que les erreurs 400 invalid request (controlleur inconnu) et 404 (page inconnu) sont différentes mais je ne le suis pas donc toutes les erreur de ce type (400/404/415/422/502) sont maintenant redirigées sur 404.
>> 8a465c306feede0efe
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@mikael-shttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1128réorganisation du menu 'file'2016-11-29T14:32:12+01:00Vidjil Teamréorganisation du menu 'file'
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@Duez
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@Duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1129Export PDF ne fonctionne pas sous FF 322016-11-29T14:32:12+01:00Vidjil TeamExport PDF ne fonctionne pas sous FF 32
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@Duez
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@Duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1130Curseur en forme de main au hover uniquement si cliquable2016-11-29T14:32:13+01:00Vidjil TeamCurseur en forme de main au hover uniquement si cliquableSi on a tout le temps le curseur en forme de main, on ne sait pas ce qui est cliquable ou ce qui ne l'est pas. En particulier sur la liste des fichiers. Il faudrait peut-être penser à faire réagir les choses cliquables pour qu'on compren...Si on a tout le temps le curseur en forme de main, on ne sait pas ce qui est cliquable ou ce qui ne l'est pas. En particulier sur la liste des fichiers. Il faudrait peut-être penser à faire réagir les choses cliquables pour qu'on comprenne ce qui est cliquable et ce qui ne l'est pas.
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confirmé
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3f78bbcb
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@Duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1131Filtrage dynamique des patients2017-07-10T17:01:30+02:00Vidjil TeamFiltrage dynamique des patientsLa table des patients risque d'être longue. Il sera utile de pouvoir filtrer par nom, par info. Ajouter une barre en haut pour pouvoir conserver (dynamiquement) les patients qui matchent.
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Je pensais aussi à un tri (par nom ? par date...La table des patients risque d'être longue. Il sera utile de pouvoir filtrer par nom, par info. Ajouter une barre en haut pour pouvoir conserver (dynamiquement) les patients qui matchent.
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Je pensais aussi à un tri (par nom ? par date ?), mais le filtrage est bien mieux.
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5a3dddb. Merci Marc, excellent
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@Duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1132Tests du CGI2018-11-20T08:51:15+01:00Vidjil TeamTests du CGI
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#1133, #1134
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@mikael-s
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#1133, #1134
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@mikael-shttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1133Tests unitaires de lazy msa2018-11-20T08:51:48+01:00Vidjil TeamTests unitaires de lazy msa
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#1132
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#1132https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1134Should get du CGI2018-11-20T08:52:00+01:00Vidjil TeamShould get du CGI
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#1132
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#1132https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1135algo: Release 2015-07, germlines.data ?2016-11-29T14:32:19+01:00Vidjil Teamalgo: Release 2015-07, germlines.data ?Vrai multi-système, avec index partagé par plusieurs germline, avec papier bioinfo ?
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Hum. Le vrai multi-système sera sûrement pour plus tard, mais déjà on en a un qui fonctionne.
Le but de 2014-12 peut plutôt être sur l'entrée des mu...Vrai multi-système, avec index partagé par plusieurs germline, avec papier bioinfo ?
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Hum. Le vrai multi-système sera sûrement pour plus tard, mais déjà on en a un qui fonctionne.
Le but de 2014-12 peut plutôt être sur l'entrée des multi-germlines
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Repoussé à 2015-01
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Repoussé à 2015-02
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repoussé...
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Re-repoussé. Ce serait tout de même bien de faire cela (avec parser C++11) avant le départ de Marc...
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Yep, c'est fait pour germlines.data, ce sera bon pour 2015-07.
Proposition : 2015-07 sera vers le milieu du mois, puis la release d'après sera 2015-09.
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Release faite, déployé sur rbx.
Test sur L4: http://rbx.vidjil.org/browser/?custom=2899&custom=3954&
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Sur M3 Diag: http://rbx.vidjil.org/browser/?custom=2909&custom=3955&
Quelques fenêtres ont changé, elle sont mieux centrées.
>TRGV2*02 -0/14/-2 TRGJ1*01 91372 reads (6.555%, 6.555% of TRG)
GGAAGGCCCCACAGCGTCTTCAGTACTATGACTCCTACAACTCCAAGGTTGTGTTGGAATCAGGAGTCAGTCCAGGGAAGTATTATACTTACGCAAGCACAAGGAACAACTTGAGATTGATACTGCAAAATCTAATTGAAAATGACTCTGGGGTCTATTACTGTGCCACCTGGGA
CGGTCTACCCCCAC
GATTATATAAGAAAACTCTTTGGCAGTGGAACAAC
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#1136, #1137
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@magiraud @mikael-shttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1136lire germlines.data2016-11-29T14:32:19+01:00Vidjil Teamlire germlines.data
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#1135
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#1135