vidjil issueshttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues2017-03-07T13:53:34+01:00https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2220Séquences productives : codon stop2017-03-07T13:53:34+01:00Mathieu GiraudSéquences productives : codon stopLe but initial de #1824 était de réfléchir sur les codons stops.
C'est fait : closed by 5d910513e par @mikael-s
Voir aussi #2142.
Le but initial de #1824 était de réfléchir sur les codons stops.
C'est fait : closed by 5d910513e par @mikael-s
Voir aussi #2142.
Algo 2017.03https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1642-w all, pour une autre configuration 'clonality' très stricte, sur toute la s...2020-04-15T09:18:24+02:00Vidjil Team-w all, pour une autre configuration 'clonality' très stricte, sur toute la séquencePeut-être pas tout le read.
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Si, si, tout le read ! Je veux au moins essayer un `-w all`.
Si les données viennent de PCR, on peut avoir des reads débutant / finissant au nucléotide près.
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Discuté à ~"PAN-Necker" :
> Si les ...Peut-être pas tout le read.
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Si, si, tout le read ! Je veux au moins essayer un `-w all`.
Si les données viennent de PCR, on peut avoir des reads débutant / finissant au nucléotide près.
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Discuté à ~"PAN-Necker" :
> Si les données viennent de PCR, on peut avoir des reads débutant / finissant au nucléotide près.
"C'est peu probable, si 1% d'erreur et > 100 bp, et bien rien ne va se ressembler"
"Sauf si le 1% est biaisé vers toujours les même erreurs"
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@magiraud @mikael-sAlgo 2017.03