vidjil issueshttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues2024-02-21T14:18:06+01:00https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/5259search field; include creator user ?2024-02-21T14:18:06+01:00THONIER Floriansearch field; include creator user ?A specific case for ~"LIL-Lille" : a patient have the same last name that a user of the team.
The search return all patients created by this users and inside the list the expected patient. Should we ?
A search with both last and firs...A specific case for ~"LIL-Lille" : a patient have the same last name that a user of the team.
The search return all patients created by this users and inside the list the expected patient. Should we ?
A search with both last and first name don't work.
One day, we will probably improve search we capacity to include field for search.
Until this time, what should we do ?Web 2024.04https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/5251500 error when opening compare samples page in some workflows2024-02-14T15:17:24+01:00CHESNIN Clement500 error when opening compare samples page in some workflows## Description
Seen in https://vdb.vidjil.org/_dashboard/ticket/9d156cdf-f59d-4543-82ac-a5ae73e0fef9 : in some case (not clearly identified yet), we do not get on id in request query, leading to a server error.
The error occurred at leas...## Description
Seen in https://vdb.vidjil.org/_dashboard/ticket/9d156cdf-f59d-4543-82ac-a5ae73e0fef9 : in some case (not clearly identified yet), we do not get on id in request query, leading to a server error.
The error occurred at least 4 times
## Reproducibility ?
A way to reproduce :
1. Go to a sample list
2. Click on a tag in the info of one of the samples
--> error occurs
There may be other way to get this error (at least with the hidden compare samples button from the patient page - but it is hidden)
## fix clue
In the HF, will be mitigated as the presence of the `id` is explicitly checked, producing a clear error and not a server failure.
However, we have to decide whether we should be able to open this kind of link and what is the expected result.
## Priority
Low?Web 2024.04https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/5019Afficher un échantillon sans l'impact des autres échantillons2023-06-30T11:13:41+02:00Mikaël SalsonAfficher un échantillon sans l'impact des autres échantillonsSuite de #2442.
Demande lors du VW. Certes on a un moyen de faire un "compare sample" sur chaque échantillon, mais ce n'est pas le plus pratique. Les utilisatrices aimeraient voir la même chose en visualisant leur run.
Aurait-on moyen ...Suite de #2442.
Demande lors du VW. Certes on a un moyen de faire un "compare sample" sur chaque échantillon, mais ce n'est pas le plus pratique. Les utilisatrices aimeraient voir la même chose en visualisant leur run.
Aurait-on moyen de restreindre la vue au top X de l'échantillon courant, sans avoir les autres clonotypes, donc ?https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/4718Export des données : exporter les sample sets dans l'ordre de leur création2022-02-09T14:42:05+01:00Mikaël SalsonExport des données : exporter les sample sets dans l'ordre de leur créationAprès l'export de données de certains utilisateurs (vdj#1166), les sample sets ne sont pas dans l'ordre de leur création mais dans un ordre qui semble arbitraire.Après l'export de données de certains utilisateurs (vdj#1166), les sample sets ne sont pas dans l'ordre de leur création mais dans un ordre qui semble arbitraire.marc duezmarc duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/4618Configuration apparaissant plusieurs fois dans les résultats2020-12-19T13:36:32+01:00Thonier FlorianConfiguration apparaissant plusieurs fois dans les résultatsJe viens de lancer des analyses sur des données d'un run avec la confid `multi+inc`. Je vois plusieurs fois celle-ci apparaître dans les boutons d'accès rapide au résultats.
Sur ce run, j'ai d'abord mis quelques fichiers demo, puis j'a...Je viens de lancer des analyses sur des données d'un run avec la confid `multi+inc`. Je vois plusieurs fois celle-ci apparaître dans les boutons d'accès rapide au résultats.
Sur ce run, j'ai d'abord mis quelques fichiers demo, puis j'ai lancé les analyse avec la config, puis ensuite j'ai modifier ces samples pour les rajouter à un individu.https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/4608My Account/Usage : pouvoir accéder aux sets2020-12-10T09:30:51+01:00Mathieu GiraudMy Account/Usage : pouvoir accéder aux sets
La liste des tags me semble utile. Mais bon, je vois un `#WM (12)`, on clique dessus et... on a toujours la page Usage, et, comme ce sont les process du dernier mois, pas forcément d'accès aux sets/samples.
Avoir un moyen de basculer s...
La liste des tags me semble utile. Mais bon, je vois un `#WM (12)`, on clique dessus et... on a toujours la page Usage, et, comme ce sont les process du dernier mois, pas forcément d'accès aux sets/samples.
Avoir un moyen de basculer sur la page patient/run/set avec la recherche déjà renseignée pour pouvoir accéder à ces sets ?
Par exemple... en cliquant sur le "12 patients" de Usage ?https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/4585My Account : corriger le compte des samples et le remettre en prod2020-12-10T09:17:28+01:00Mathieu GiraudMy Account : corriger le compte des samples et le remettre en prodSur `dev`, en tant que `user_15`, j'ai uploadé 1 nouveau set avec 4 samples.
My Account m'affiche "sets: 2 (samples: 2)" (j'avais un autre set auparavant).
Surtout, je vois partout un même nombre de "samples" que les sets...
Pour ne pa...Sur `dev`, en tant que `user_15`, j'ai uploadé 1 nouveau set avec 4 samples.
My Account m'affiche "sets: 2 (samples: 2)" (j'avais un autre set auparavant).
Surtout, je vois partout un même nombre de "samples" que les sets...
Pour ne pas bloquer #4562, on pourrait mettre ces infos en dev-mode.https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/4584My Account/Usage: inclure les tags des sets ?2021-04-08T16:32:58+02:00Mathieu GiraudMy Account/Usage: inclure les tags des sets ?Ne bloque pas #4562
Pour l'instant la page affiche uniquement les tags des samples.
Cela peut convenir à certains usagers, mais pas à d'autres qui utilisent les tags sur des sets.Ne bloque pas #4562
Pour l'instant la page affiche uniquement les tags des samples.
Cela peut convenir à certains usagers, mais pas à d'autres qui utilisent les tags sur des sets.https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/4572Pouvoir cliquer avec le bouton droit sur des liens sample sets2020-11-20T21:15:48+01:00Mathieu GiraudPouvoir cliquer avec le bouton droit sur des liens sample sets
Si on arrive sur un run avec 50+ patients, on peut souhaiter ouvrir un certain nombre d'onglets avec ces patients. Ce n'est pas possible pour le moment.
Serait ~"!-easy", mais... nécessite #4571 qui est bien plus dur.
Si on arrive sur un run avec 50+ patients, on peut souhaiter ouvrir un certain nombre d'onglets avec ces patients. Ce n'est pas possible pour le moment.
Serait ~"!-easy", mais... nécessite #4571 qui est bien plus dur.https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/4571API / URL serveur : arriver sur une page d'un set2021-03-29T16:16:46+02:00Mathieu GiraudAPI / URL serveur : arriver sur une page d'un setÉtait déjà mentionné dans #1188 il y a plus de 4 ans ;)
https://app.vidjil.org/4845-25 ouvre le client, set 4845, config 25.
Serait-il raisonnable que https://app.vidjil.org/4845 fasse atterrir sur la page ~"client-database" du set ?
...Était déjà mentionné dans #1188 il y a plus de 4 ans ;)
https://app.vidjil.org/4845-25 ouvre le client, set 4845, config 25.
Serait-il raisonnable que https://app.vidjil.org/4845 fasse atterrir sur la page ~"client-database" du set ?
cc @duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/4569Pouvoir associer d'un coup plusieurs samples à un set / créer un nouveau set ...2020-12-11T11:53:00+01:00Mathieu GiraudPouvoir associer d'un coup plusieurs samples à un set / créer un nouveau set avec des samples existantsUtile par exemple quand on crée de nombreux patients et qu'on se rend compte ensuite qu'on a oublié un set. Ou tout simplement... on décide de faire du rangement et de créer des nouveaux sets.
Pas évident de voir quel serait le bon chem...Utile par exemple quand on crée de nombreux patients et qu'on se rend compte ensuite qu'on a oublié un set. Ou tout simplement... on décide de faire du rangement et de créer des nouveaux sets.
Pas évident de voir quel serait le bon chemin UX pour cela... avoir un bouton "add existing sample" sur la page du set ? Mais comment alors en sélectionner potentiellement beaucoup ?https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/4551Avoir une confirmation utilisateur pour créer/uploader des données sur un ser...2020-12-04T18:21:59+01:00Mathieu GiraudAvoir une confirmation utilisateur pour créer/uploader des données sur un serveur non-HDS
En discutant de !813, suggestion de @duez : sur des serveurs non-HDS, faire que le bouton `save/upload` à la création de données potentiellement sensibles soit grisé, avec une case à cocher pour que l'usager indique que ses données sont...
En discutant de !813, suggestion de @duez : sur des serveurs non-HDS, faire que le bouton `save/upload` à la création de données potentiellement sensibles soit grisé, avec une case à cocher pour que l'usager indique que ses données sont bien autorisées à aller sur ce serveur.
Cela va clairement plus loin que #4506 mais peut être nécessaire pour mieux sensibiliser les usagers et clarifier les responsabilités de chacun.https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/4498Création multiple de patients ne fonctionne pas si une colonne est vide2020-09-29T14:32:55+02:00Mikaël SalsonCréation multiple de patients ne fonctionne pas si une colonne est videJe suis dans cette situation-là
![paste](/uploads/bfe46a19a413e553ac21ea3a1c9f0522/paste.png)
Et lorsque je colle on me dit que le format n'est pas correct. Il semble que la dernière colonne ne soit pas prise en compte. Dès que je mets...Je suis dans cette situation-là
![paste](/uploads/bfe46a19a413e553ac21ea3a1c9f0522/paste.png)
Et lorsque je colle on me dit que le format n'est pas correct. Il semble que la dernière colonne ne soit pas prise en compte. Dès que je mets quelque chose sur une des lignes de la dernière colonne c'est ok.
Même problème si c'est la 1è colonne.marc duezmarc duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/4497Date de naissance qui ne passe pas bien avec la création en masse de patients...2020-10-21T08:26:04+02:00Mikaël SalsonDate de naissance qui ne passe pas bien avec la création en masse de patients depuis EthercalcJ'ai fait une démo avec Framacalc et la date de naissance est transformée en un entier ce qui n'est, du coup, pas accepté.
https://lite.framacalc.org/9j8a-q87yj1pvao
Si ce n'est qu'avec Framacalc ce n'est pas dramatique, mais je crains...J'ai fait une démo avec Framacalc et la date de naissance est transformée en un entier ce qui n'est, du coup, pas accepté.
https://lite.framacalc.org/9j8a-q87yj1pvao
Si ce n'est qu'avec Framacalc ce n'est pas dramatique, mais je crains que ce soit lorsque le tableur reconnaît qu'il s'agit d'une date et la transforme ensuite.marc duezmarc duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/4478clipboard.js et données incomplètes2020-09-22T09:18:56+02:00Mathieu Giraudclipboard.js et données incomplètesSuite à !783.
| | | | | |
|-----|---------|-------|------------|------|
| 42 | John | Doe | | #ALL |
| | George | Sand | 1804-02-01 | |
Si ce que je colle dans la dernière l...Suite à !783.
| | | | | |
|-----|---------|-------|------------|------|
| 42 | John | Doe | | #ALL |
| | George | Sand | 1804-02-01 | |
Si ce que je colle dans la dernière ligne ne va pas jusqu'au `\n`, alors le contenu de la dernière ligne est oublié.
C'est peut-être ~"priority-1-low", depuis un tableur cela n'arrive pas ?
cc @duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/4477clipboard.js et double clic2020-09-22T09:22:14+02:00Mathieu Giraudclipboard.js et double clicThe following discussion from https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/merge_requests/783#note_383367 should be addressed:
Il est possible de faire un doubleclick. Il faudrait prévenir ce comportement par une désactivation temporaire du ...The following discussion from https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/merge_requests/783#note_383367 should be addressed:
Il est possible de faire un doubleclick. Il faudrait prévenir ce comportement par une désactivation temporaire du bouton.
> !641
> !291
@duez : "le plus simple que j'ai pu, une petite fonction antiSpam() qui joue avec la propriete css `pointer-events:none,` facile a rajouter sur tout les events js sensible."
```onclick="readClipBoard('run'); antiSpam(this, 1000)"```
@mikael-s: "Pourquoi ne pas réutiliser `temporarilyDisableClickedLink` de !641 ?marc duezmarc duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/4476Set creation should ignore leading/trailing spaces2024-03-27T14:28:29+01:00Mathieu GiraudSet creation should ignore leading/trailing spacesSi je rentre `2020-02-15 ` dans un champ date, avec un espace à la fin, cela ne passe pas au validateur et c'est bloquant.
Cela peut arriver encore plus souvent avec !783
Plus généralement, on pourrait enlever tous les espaces, pour le...Si je rentre `2020-02-15 ` dans un champ date, avec un espace à la fin, cela ne passe pas au validateur et c'est bloquant.
Cela peut arriver encore plus souvent avec !783
Plus généralement, on pourrait enlever tous les espaces, pour les prénoms / noms aussi.marc duezmarc duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/4461Affichage de samples en double dans un run/set2020-12-10T09:27:28+01:00Anne de SeptenvilleAffichage de samples en double dans un run/setLors de l'ajout de multiples samples dans un run, j'ai par erreur mis 2 fois le run dans les "common sets".
Résultats, mes 8 samples apparaissent tous en double dans le run (39427). Cependant je les vois comme unique si je sélectionne ...Lors de l'ajout de multiples samples dans un run, j'ai par erreur mis 2 fois le run dans les "common sets".
Résultats, mes 8 samples apparaissent tous en double dans le run (39427). Cependant je les vois comme unique si je sélectionne une analyse dans le menu déroulant.https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/4402Pouvoir modifier les samples en lot2020-07-10T09:29:33+02:00Thonier FlorianPouvoir modifier les samples en lotJ'ai chargé les données d'une publication contenant 7 samples.
Après lecture de la publication, j'ai décidé de rajouter des informations qui n'étaient pas présentes dans la description des données. Malheureusement, j'ai du ouvrir un pa...J'ai chargé les données d'une publication contenant 7 samples.
Après lecture de la publication, j'ai décidé de rajouter des informations qui n'étaient pas présentes dans la description des données. Malheureusement, j'ai du ouvrir un par un les samples pour ajouter cette information. Une version ou l'on pourrait mettre à jour un ensemble de sample aurait été plus rapide.https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/4392Sample apparaissant en double dans la vue database2020-07-01T11:32:05+02:00Thonier FlorianSample apparaissant en double dans la vue databaseJ'ai cherché une issue car il me semble que c'était déjà arriver, mais je n'ai pas trouvé.
J'ai un patient (38786) dont certains sample apparaissent plusieurs fois dans la liste (config null). En revanche, si je sélectionne une config (...J'ai cherché une issue car il me semble que c'était déjà arriver, mais je n'ai pas trouvé.
J'ai un patient (38786) dont certains sample apparaissent plusieurs fois dans la liste (config null). En revanche, si je sélectionne une config (`default` par exemple), je me retrouve alors avec une seule occurrence de chaque sample.
Le nombre de fois ou un sample est visible n'est pas constant non plus. Certain apparaissent 2 fois, d'autre 3 et enfin un 4fois.
![Screenshot_20200701_105823](/uploads/db698ee347b8f5b24b250f263471905f/Screenshot_20200701_105823.png)