vidjil issueshttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues2017-01-31T17:37:57+01:00https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1175Vue admin: savoir de qui vient chaque fichier2017-01-31T17:37:57+01:00Vidjil TeamVue admin: savoir de qui vient chaque fichierpar exemple comme ce qui se fait pour les configs: avoir une simple liste de type
Lille, ECNGS
de ceux qui ont accès en dehors de System admin
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479944e : pour l'instant une liste d'ids de groupes
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Qui a fait quoi, déjà uploa...par exemple comme ce qui se fait pour les configs: avoir une simple liste de type
Lille, ECNGS
de ceux qui ont accès en dehors de System admin
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479944e : pour l'instant une liste d'ids de groupes
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Qui a fait quoi, déjà uploader
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@Duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1172IMGT API: récupérer directement en .csv, intégrer des résultats au segmenter2016-11-29T14:32:44+01:00Vidjil TeamIMGT API: récupérer directement en .csv, intégrer des résultats au segmenterRévolution à Montpellier : pourraient-ils avoir une API ? Pour V-QUEST ?
Véronique nous conseille de demander par mail à elle + MPL + Patrice Duroux
(PD : 3D, adminsys pour tout IMGT)
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Peut-être leur faire coucou par mail cette semai...Révolution à Montpellier : pourraient-ils avoir une API ? Pour V-QUEST ?
Véronique nous conseille de demander par mail à elle + MPL + Patrice Duroux
(PD : 3D, adminsys pour tout IMGT)
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Peut-être leur faire coucou par mail cette semaine, avant que Marc n'aille les voir ?
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ok, mail envoyé, à voir si on a des nouvelles mardi ou plus tard...
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il n'étaient pas prêt à faire un POST, le formulaire leur va très bien...
En rediscuter dans longtemps, disons 6 mois.
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Confirmé, Véronique fait cela en mai (mais tjs formulaire)
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IMGT relancé vendredi 12 juin
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"Ce sera pour la prochaine version d'IMGT/V-QUEST".
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C'est à nous de le faire... au minimum, répondre...
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Ce serait bien d'avoir avancé là-dessus avant EC-NGS, où on va forcément les voir...
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mail avant EC-NGS, Ryan pourrait s'y mettre en novembre ?
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Pour fin novembre (cf mail IMGT)
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-> François nov/déc
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Libby/Fred hier soir soutiennent complètement ce point.
IMGT et Vidjil sont complémentaires.
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On fera un mail à IMGT lorsque François aura un truc fonctionnel.
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Yeah.
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@RyanHerbhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1171Tous les ans, mettre à jour les librairies .js2022-04-22T08:29:40+02:00Vidjil TeamTous les ans, mettre à jour les librairies .jsEt d'autres librairies si besoin...
S'assurer que `browser/js/lib/info.txt` est à jour
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Marc, 9a8c272d6 (septembre 2014) :
* d3js updated
* jquery updated (use jquery 2)
* jquery.form updated
* jspdf updated
* canvg ...Et d'autres librairies si besoin...
S'assurer que `browser/js/lib/info.txt` est à jour
***
Marc, 9a8c272d6 (septembre 2014) :
* d3js updated
* jquery updated (use jquery 2)
* jquery.form updated
* jspdf updated
* canvg removed (never used)
* less.js removed (we don't compil css in the browser anymore)
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merci !
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Ping. Cela fait presque 18 mois que certaines librairies n'ont pas été mises à jour. On peut vivre avec, mais...
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Marc, est-ce que c'est quelque chose que tu pourrais faire avant ton départ ? Merci.
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@Duez2016-12-12https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1162Surveiller les erreurs / tickets sur le serveur / tickets à envoyer par mail2016-11-29T14:32:37+01:00Vidjil TeamSurveiller les erreurs / tickets sur le serveur / tickets à envoyer par mailhttps://rbx.vidjil.org/admin/default/errors/vidjil
https://rbx.vidjil.org/admin/default/errors/admin
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Je viens de faire une passe de mon côté, en supprimant ce qui venait de mes manips.
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Marc, cela vaut le coup que tu y jettes un c...https://rbx.vidjil.org/admin/default/errors/vidjil
https://rbx.vidjil.org/admin/default/errors/admin
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Je viens de faire une passe de mon côté, en supprimant ce qui venait de mes manips.
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Marc, cela vaut le coup que tu y jettes un coup d'oeil... des erreurs ici signifient des utilisateurs qui ne savent pas quoi faire ;-)
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priorité baissée, il n'y a pas trop d'erreurs en ce moment
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Ce serait tout de même bien plus robuste d'avoir cela par mail, ou au moins dans le log.
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@magiraud @mikael-shttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1160web2py devrait se mettre dans /mnt/result pour se lancer2016-11-29T14:32:35+01:00Vidjil Teamweb2py devrait se mettre dans /mnt/result pour se lancer0764e95. On ne fait pas de os.chdir, mais les fichiers de résultats sont directement dans /mnt/result
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@magiraud @mikael-s0764e95. On ne fait pas de os.chdir, mais les fichiers de résultats sont directement dans /mnt/result
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@magiraud @mikael-shttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1157Sélection multiple sur OS X avec xxx+clic2016-11-29T14:32:33+01:00Vidjil TeamSélection multiple sur OS X avec xxx+clicActuellement, ne marche plus sur OS X ?
Avant, c'était toujours multiple, je sais qu'on a changé... à rediscuter
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je confirme, marche pas chez moi :-)
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Je confirme : sous OSX, ni Shift, ni Pomme, ni Ctrl, ni Alt ne permet de faire ...Actuellement, ne marche plus sur OS X ?
Avant, c'était toujours multiple, je sais qu'on a changé... à rediscuter
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je confirme, marche pas chez moi :-)
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Je confirme : sous OSX, ni Shift, ni Pomme, ni Ctrl, ni Alt ne permet de faire une sélection multiple. Je n'ai pas essayé les 16 combinaisons :-)
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(que ce soit sous Safari ou sous Firefox)
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Ce bug est plus que confirmé, plusieurs utilsateurs sous OS X ne peuvent pas faire des sélections multiples.
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il y avait une personne sous Mac (Ludovic ?) qui arrivait à faire de la sélection multiple (avec pomme ou shift+pomme)
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b461f5c. Yououh, après plus d'un an d'abstinence je découvre la sélection multiple. Quelle belle application :-)
(Merci de vérifier que cela passe pour vous, alt/ctrl/meta devraient être acceptés)
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@nobodyhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1151'Last processing' devrait aussi afficher l'heure2016-11-29T14:32:29+01:00Vidjil Team'Last processing' devrait aussi afficher l'heureQue ce soit dans la vue des points ou dans la vue admin, on aimerait avoir l'heure, par exemple "2014-09-17 10:04". En particulier quand on est en train de lancer des choses ou de les monitorer (ou de relancer tout), l'heure est importan...Que ce soit dans la vue des points ou dans la vue admin, on aimerait avoir l'heure, par exemple "2014-09-17 10:04". En particulier quand on est en train de lancer des choses ou de les monitorer (ou de relancer tout), l'heure est importante
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@Duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1147Re-partitionner /home2016-11-29T14:32:26+01:00Vidjil TeamRe-partitionner /home600 Go : upload (fasta), vérifier que les fichiers arrivent direct dedans
100 Go : résultat + espace travail Vidjil-algo/Brno
le reste > 100 Go : home (www-data n'écrit pas, sauf peut-être pour le dev dans le git)
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/dev/sda2 réduite à...600 Go : upload (fasta), vérifier que les fichiers arrivent direct dedans
100 Go : résultat + espace travail Vidjil-algo/Brno
le reste > 100 Go : home (www-data n'écrit pas, sauf peut-être pour le dev dans le git)
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/dev/sda2 réduite à 600 GB
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/dev/sda2 600GB /mnt/upload (à maximiser, elle ne fait que 500 GB ?)
/dev/sda5 100GB /home
/dev/sda6 200GB /result
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pour le log:
e2fsck -f /dev/sda2
resize2fs /dev/sda2 600G
resize2fs /dev/sda2 500G (pour être sur d'avoir assez de place, je ne suis pas sûr de comment ils comptent les G entre resize2fs et fdisk)
fdisk > supprimer > recréer les partitions
e2fsck -f /dev/sda2
puis /etc/fstab
puis déplacement à la mimine de ce qui doit revenir dans /home
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resize2fs sur /dev/sda2 : 591 GB
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@magiraud @mikael-shttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1142Visualiser la sortie standard de ce qui a tourné2016-11-29T14:32:23+01:00Vidjil TeamVisualiser la sortie standard de ce qui a tournéA côté du "last processed", un petit bouton pour visualiser la sortie standard du dernier calcul de Vidjil-algo/autre logiciel.
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accesible en cliquant sur last processing date => info du run correspondant (output/status/date)
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Yeah...A côté du "last processed", un petit bouton pour visualiser la sortie standard du dernier calcul de Vidjil-algo/autre logiciel.
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accesible en cliquant sur last processing date => info du run correspondant (output/status/date)
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Yeah, cela va être super pratique, merci !
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Et puis idéalement, on aimerait aussi pouvoir la voir dans la vue admin
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'\n', ok maintenant
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@Duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1126Database (+ lancement ?)2016-11-29T14:32:10+01:00Vidjil TeamDatabase (+ lancement ?)
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#1123
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#1123https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1125Algo (non, attente) (mais si, -g fonctionne...)2016-11-29T14:32:10+01:00Vidjil TeamAlgo (non, attente) (mais si, -g fonctionne...)
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#1123
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#1123https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1124Visualisation (presque bon)2016-11-29T14:32:10+01:00Vidjil TeamVisualisation (presque bon)
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#1123
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#1123https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1123Diagnostic multi-systèmes2016-11-29T14:32:10+01:00Vidjil TeamDiagnostic multi-systèmesQue ce soit à Lille ou à Necker, la première application en routine de Vidjil va être probablement sur le diagnostic.
Même sans attendre l'"Algo multi-systèmes", on peut déjà avoir quelque chose pour nos collègues.
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On va dire que c'e...Que ce soit à Lille ou à Necker, la première application en routine de Vidjil va être probablement sur le diagnostic.
Même sans attendre l'"Algo multi-systèmes", on peut déjà avoir quelque chose pour nos collègues.
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On va dire que c'est bon, des tâches plus précises sont là pour les différents points
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#1124, #1125, #1126
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@Duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1121Mathieu: compléter ce fichier avec un diff2016-11-29T14:32:05+01:00Vidjil TeamMathieu: compléter ce fichier avec un diff
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#1118
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#1118https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1120Marc: faire un fichier python qui itère sur les couples de fichiers (old, new)2016-11-29T14:32:05+01:00Vidjil TeamMarc: faire un fichier python qui itère sur les couples de fichiers (old, new)
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#1118
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#1118https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1119Marc: ne pas supprimer les anciens runs2016-11-29T14:32:05+01:00Vidjil TeamMarc: ne pas supprimer les anciens runs
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#1118
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#1118https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1118Méga-test fonctionnel, cohérence entre plusieurs "runs" à des mois d'intervalle2016-11-29T14:32:05+01:00Vidjil TeamMéga-test fonctionnel, cohérence entre plusieurs "runs" à des mois d'intervalleJuste des réflexions, on en parlera un jour ensemble.
Lors d'une évolution de vidjil/algo, serait-ce intéressant de comparer sur *tous* les fichiers de la database que les résultats sont toujours bons ?
Ou bien lorsque l'admin ferait "...Juste des réflexions, on en parlera un jour ensemble.
Lors d'une évolution de vidjil/algo, serait-ce intéressant de comparer sur *tous* les fichiers de la database que les résultats sont toujours bons ?
Ou bien lorsque l'admin ferait "relance all" ?
Autre manière de voir la chose : si un utilisateur fait "run" et qu'on a amélioré/changé le cpp, il ne trouve pas forcément la même chose. C'est voulu / documenté / warning ? Peut-il revenir en arrière s'il n'est pas content ?
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Marc, merci de regarder rapidement cela, tu nous disais mercredi dernier que c'était facile de ne pas supprimer les anciens runs... J'en ai besoin pour relancer sur rbx avec la nouvelle version
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e8b0805 compare-last-results.py
pour l'instant lancement manuel, on verra comment on améliorera cela ensuite
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#1119, #1120, #1121
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@magiraudhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1116"See result TRG" devrait fermer la boîte de dialogue de la base de données2016-11-29T14:32:00+01:00Vidjil Team"See result TRG" devrait fermer la boîte de dialogue de la base de données
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@Duez
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@Duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1115Liste des 10 derniers patients/config visualisés directement accessible dans ...2016-11-29T14:31:59+01:00Vidjil TeamListe des 10 derniers patients/config visualisés directement accessible dans le menuPar exemple "Leu Ant IGH"
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@DuezPar exemple "Leu Ant IGH"
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@Duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1112éventuellement, dans la liste des patients, taille totale2016-11-29T14:31:57+01:00Vidjil Teaméventuellement, dans la liste des patients, taille totale
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#1110
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#1110