vidjil issueshttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues2018-01-19T11:16:30+01:00https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/3000Option pour afficher le json bien formaté sur stdout et/ou format_json plus i...2018-01-19T11:16:30+01:00Mathieu GiraudOption pour afficher le json bien formaté sur stdout et/ou format_json plus intéressantPlusieurs tests visent le json (`cat bla.vidjil | python format_json.py`).
J'ai plusieurs fois été frustré de ce que je pouvais tester dans le json. Une sortie "une ligne par clone" serait agréable à tester. Avoir une option pour cela d...Plusieurs tests visent le json (`cat bla.vidjil | python format_json.py`).
J'ai plusieurs fois été frustré de ce que je pouvais tester dans le json. Une sortie "une ligne par clone" serait agréable à tester. Avoir une option pour cela dans `format_json` ? Ou bien dans le ~cpp ?https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2919TEST_TAP_EQUAL pour les tests unitaires2018-01-18T00:35:54+01:00Mathieu GiraudTEST_TAP_EQUAL pour les tests unitairesMême remarque que #2823 pour les tests unitaires ~cpp .
Moins important, nos tests sont tout de même bien stables et c'est facile de débugger si besoin.Même remarque que #2823 pour les tests unitaires ~cpp .
Moins important, nos tests sont tout de même bien stables et c'est facile de débugger si besoin.https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2879Pouvoir changer la couleur affectée à chaque tag2019-12-10T13:51:47+01:00Mathieu GiraudPouvoir changer la couleur affectée à chaque tagPas sûr que ce soit demandé ou utile.Pas sûr que ce soit demandé ou utile.https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2815Hover sur la quantité / + / - pourrait indiquer "xxx reads"2022-01-19T09:15:46+01:00Mathieu GiraudHover sur la quantité / + / - pourrait indiquer "xxx reads"Discuté ensemble. C'était le cas il y a un certain temps.Discuté ensemble. C'était le cas il y a un certain temps.https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2807URL: le plot preset devrait être correctement initialisé, ou au moins non ini...2017-11-19T22:15:41+01:00Mathieu GiraudURL: le plot preset devrait être correctement initialisé, ou au moins non initialisé à 0Obtenu avec le preset 5 : http://feature-c-url-params.ci.vidjil.org/?data=analysis-example.vidjil&p=v,size,bar
Mais le preset n'est pas initialisé (c'est normal, le preset est juste une manière de mettre des axes x et y), il est à `0 V/...Obtenu avec le preset 5 : http://feature-c-url-params.ci.vidjil.org/?data=analysis-example.vidjil&p=v,size,bar
Mais le preset n'est pas initialisé (c'est normal, le preset est juste une manière de mettre des axes x et y), il est à `0 V/J gene`, ce qui est trompeur.
Idéalement, on aimerait voir le bon preset 5, mais c'est difficile.
Déjà, quelque chose qui induirait moins en erreur serait, lors du chargement d'une URL avec `plot`, de ne pas mettre le preset 0.https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2799Less et couleurs en minuscules2019-02-05T19:00:54+01:00Mathieu GiraudLess et couleurs en minusculesChez moi, mon compilateur less voudrait mettre toutes les couleurs hex en minuscules.
@mikael-s : "Si c'est pareil chez tout le monde, on pourrait le pousser"
cc @RyanHerbChez moi, mon compilateur less voudrait mettre toutes les couleurs hex en minuscules.
@mikael-s : "Si c'est pareil chez tout le monde, on pourrait le pousser"
cc @RyanHerbhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2789Short name et VDJ/VDDJ : réduire le seuil de 6 ?2018-08-07T09:13:28+02:00Thonier FlorianShort name et VDJ/VDDJ : réduire le seuil de 6 ?Je me suis aperçu que lors de l'affichage de clones avec des D en tandem, la transformation en short name ne ce fait pas sur l'insert `N-4b-3`, et peut-être aussi sur le `N-4a-4`.Je me suis aperçu que lors de l'affichage de clones avec des D en tandem, la transformation en short name ne ce fait pas sur l'insert `N-4b-3`, et peut-être aussi sur le `N-4a-4`.Thonier FlorianThonier Florianhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2713Déployer automatiquement les tags par défaut sur une nouvelle installation2022-06-24T14:30:41+02:00Mathieu GiraudDéployer automatiquement les tags par défaut sur une nouvelle installationVoir #2683 et doc/tags.org.Voir #2683 et doc/tags.org.https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2709Support des langages LTR et concaténation de chaînes2017-10-17T08:38:53+02:00Mathieu GiraudSupport des langages LTR et concaténation de chaînesPouvons-nous rentrer un nom de patient en arabe ?
Apparament oui, mais on voit ensuite "خلدون ابن (36)" à la place de "Toto Tata (36)". Voir sur `dev`.Pouvons-nous rentrer un nom de patient en arabe ?
Apparament oui, mais on voit ensuite "خلدون ابن (36)" à la place de "Toto Tata (36)". Voir sur `dev`.https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2608N'afficher que les patients avec des mise à jours non encore visualisées par ...2017-10-17T16:49:57+02:00Thonier FlorianN'afficher que les patients avec des mise à jours non encore visualisées par l'utilisateurOriginalement dans #2607 :
> - toutes les analyses non encore visualisées.
>
> - un mix des trois (au choix les XXX dernier jobs ou bien si ca dépasse les jobs depuis XXX jours, avec e nplus une colonne qui indique si il reste un jobs ...Originalement dans #2607 :
> - toutes les analyses non encore visualisées.
>
> - un mix des trois (au choix les XXX dernier jobs ou bien si ca dépasse les jobs depuis XXX jours, avec e nplus une colonne qui indique si il reste un jobs en attente sur ce patient.
Je me demande si il ne serait aps possible de filtrer la liste des patients avec uniquement les patients (ou runs/sets, comme d'hab) qui ont reçu une update non encore vue par l'utilisateur.
@RyanHerb @magiraud @mikael-shttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2509Aligneur : paramétrer pour que les alignements soient jolis2023-01-25T09:41:58+01:00Mathieu GiraudAligneur : paramétrer pour que les alignements soient jolisSuite à #2501, mieux paramétrer pour que l'alignement soit joli. Pas urgent.
cc @aurelBZHSuite à #2501, mieux paramétrer pour que l'alignement soit joli. Pas urgent.
cc @aurelBZHhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2450Scatterplot responsive : adapter l'axe et le nombre de labels2018-10-16T09:58:29+02:00Mathieu GiraudScatterplot responsive : adapter l'axe et le nombre de labelsQuand on a peu de place en largeur, on devrait afficher moins de labels.
Voir aussi #2421.
cc @heto @RyanHerbQuand on a peu de place en largeur, on devrait afficher moins de labels.
Voir aussi #2421.
cc @heto @RyanHerbhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2436Axes, colonnes, pretty, fillAxisBox et DOM2017-05-31T15:50:14+02:00Mathieu GiraudAxes, colonnes, pretty, fillAxisBox et DOMEn faisant #2396, notamment 4253885d, j'ai du mettre `.outerHTML` à la fin de fonctions `pretty()`.
Ne pourrait-on pas remplacer le `span.innerHTML = clone.getPrettyAxisValue(axOpts[i]);` par des manipulations de DOM pour ne pas avoir à...En faisant #2396, notamment 4253885d, j'ai du mettre `.outerHTML` à la fin de fonctions `pretty()`.
Ne pourrait-on pas remplacer le `span.innerHTML = clone.getPrettyAxisValue(axOpts[i]);` par des manipulations de DOM pour ne pas avoir à faire de `inner/outerHTML` ?
https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2359Limiter la mémoire allouée aux jobs lancés via les workers2021-11-22T13:51:54+01:00Mathieu GiraudLimiter la mémoire allouée aux jobs lancés via les workersEn complément de #2349, on pourrait limiter la quantité de mémoire par worker ou sur tous les workers. On aimerait ainsi que, même dans des cas non prévus, le serveur réponde toujours même si un process fait n'importe quoi.
Voir http://...En complément de #2349, on pourrait limiter la quantité de mémoire par worker ou sur tous les workers. On aimerait ainsi que, même dans des cas non prévus, le serveur réponde toujours même si un process fait n'importe quoi.
Voir http://coldattic.info/shvedsky/pro/blogs/a-foo-walks-into-a-bar/posts/40, qui discute longuement certaines possibilités.
(On pourrait d'ailleurs avoir une solution non universelle, et par exemple protéger MiXCR par un `ulimit` si cela fonctionne.)https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2289Utilisateurs: avoir une colonne "groups" plus explicite2023-10-26T16:16:07+02:00Mathieu GiraudUtilisateurs: avoir une colonne "groups" plus expliciteLa colonne est un peu cryptique. On pourrait mettre les admins d'une certaine façon, et mettre (au moins en :hover) les noms des groupes. Peut-être même enlever le groupe attaché à l'utilisateur ?
cc @mikael-s @RyanHerbLa colonne est un peu cryptique. On pourrait mettre les admins d'une certaine façon, et mettre (au moins en :hover) les noms des groupes. Peut-être même enlever le groupe attaché à l'utilisateur ?
cc @mikael-s @RyanHerbhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2286Utilisateurs: pays et position2017-03-22T21:15:38+01:00Mathieu GiraudUtilisateurs: pays et positionUniquement pour de la ~com, par exemple pour la carte des utilisateurs... mais aussi pour mieux connaître nos utilisateurs.
Si l'on veut se mettre aux emoji (🇨🇳 🇫🇷...) l'avantage est qu'ils suivent les codes à deux lettres ISO 3166-1.
...Uniquement pour de la ~com, par exemple pour la carte des utilisateurs... mais aussi pour mieux connaître nos utilisateurs.
Si l'on veut se mettre aux emoji (🇨🇳 🇫🇷...) l'avantage est qu'ils suivent les codes à deux lettres ISO 3166-1.
(Au passage, rigolo chez moi, entre "write" et "preview", ce n'est pas le même set d'emojis).
cc @mikael-s @RyanHerbhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2283app/analyze: mauvais affichage lorsqu'il n'y a que des séquences non segmentées2023-03-01T17:09:18+01:00Mathieu Giraudapp/analyze: mauvais affichage lorsqu'il n'y a que des séquences non segmentéesLa grid à droite n'affiche rien si on lance sur ~"app-analyze"
```
>vdfgdfg
AACACAAAA
>dfgdfg
ACACGTGT
```
Alors que si on rajoute une séquence segmentable, tout fonctionne, les séquences apparaissent en `xxx`.
cc @mikael-sLa grid à droite n'affiche rien si on lance sur ~"app-analyze"
```
>vdfgdfg
AACACAAAA
>dfgdfg
ACACGTGT
```
Alors que si on rajoute une séquence segmentable, tout fonctionne, les séquences apparaissent en `xxx`.
cc @mikael-shttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2238Avoir une doc au format manpage pour le paquet algo2017-12-13T07:22:14+01:00Ryan HerbertAvoir une doc au format manpage pour le paquet algoOn pourrait avoir une man page qui s'installe avec le paquet debian de l'algo.
https://liw.fi/manpages/On pourrait avoir une man page qui s'installe avec le paquet debian de l'algo.
https://liw.fi/manpages/https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2231Le :hover sur les histogrammes reste trop longtemps2021-11-23T16:55:16+01:00Mathieu GiraudLe :hover sur les histogrammes reste trop longtempsQuand on passe en :hover en `MODE_BAR`, tout le rectangle est noir, mais il le reste un peu trop longtemps après qu'on ait quitté le :hover (contrairement au `MODE_GRID` où la bulle revient tout de suite en couleur)
cc @RyanHerb @mikael-sQuand on passe en :hover en `MODE_BAR`, tout le rectangle est noir, mais il le reste un peu trop longtemps après qu'on ait quitté le :hover (contrairement au `MODE_GRID` où la bulle revient tout de suite en couleur)
cc @RyanHerb @mikael-shttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2221Faire un mock pour window pour les tests QUnit bidouillant l'url2018-02-23T10:04:52+01:00Mathieu GiraudFaire un mock pour window pour les tests QUnit bidouillant l'urlOn aimerait mieux tester `url_obs.js` fait par @aurelBZH, pour être plus robuste par rapport au comportement de QUnit vis-à-vis de l'url.
@RyanHerb propose de faire un "mock". Par exemple un mock de `window`, utilisé dans notre code com...On aimerait mieux tester `url_obs.js` fait par @aurelBZH, pour être plus robuste par rapport au comportement de QUnit vis-à-vis de l'url.
@RyanHerb propose de faire un "mock". Par exemple un mock de `window`, utilisé dans notre code comme `window.history.pushState('plop', 'plop', new_url);` et `window.location`.
Voir par exemple http://stackoverflow.com/questions/14627367/mock-window-location-reload-using-qunit
cc @mikael-s