vidjil issueshttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues2017-08-28T15:57:38+02:00https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1401algo/tools: réparer cut.cpp2017-08-28T15:57:38+02:00Vidjil Teamalgo/tools: réparer cut.cppcut.cpp peut être éventuellement intéressant, à réparer (+ tester / should)
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@nobodycut.cpp peut être éventuellement intéressant, à réparer (+ tester / should)
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@nobodyhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2436Axes, colonnes, pretty, fillAxisBox et DOM2017-05-31T15:50:14+02:00Mathieu GiraudAxes, colonnes, pretty, fillAxisBox et DOMEn faisant #2396, notamment 4253885d, j'ai du mettre `.outerHTML` à la fin de fonctions `pretty()`.
Ne pourrait-on pas remplacer le `span.innerHTML = clone.getPrettyAxisValue(axOpts[i]);` par des manipulations de DOM pour ne pas avoir à...En faisant #2396, notamment 4253885d, j'ai du mettre `.outerHTML` à la fin de fonctions `pretty()`.
Ne pourrait-on pas remplacer le `span.innerHTML = clone.getPrettyAxisValue(axOpts[i]);` par des manipulations de DOM pour ne pas avoir à faire de `inner/outerHTML` ?
https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1433fuse.py n'arrive plus a fusionner des fichier clntab et vidjil2017-05-18T15:54:25+02:00Vidjil Teamfuse.py n'arrive plus a fusionner des fichier clntab et vidjil
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@Duez
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@Duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1030Tests .should-get ne concernant pas l'algo2017-05-18T11:17:57+02:00Vidjil TeamTests .should-get ne concernant pas l'algoil y a maintenant des .should_get qui concernent autre chose que l'algo
- md5 data/germlines
- fuse.py
Où devraient-ils être ? Et où doit être le test d'intégration continue (vidjil-data) ?
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toujours d'actualité
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De plus, c'e...il y a maintenant des .should_get qui concernent autre chose que l'algo
- md5 data/germlines
- fuse.py
Où devraient-ils être ? Et où doit être le test d'intégration continue (vidjil-data) ?
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toujours d'actualité
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De plus, c'est le bazar dans algo/tests/... on devrait ranger, par exemple :
./unit-tests/
./should-vdj-tests/
./should_get-tests/
./logs/
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55b80e0, rangement.
La tâche reste ouverte pour la question initiale : que fait-on des .should-get qui concernent autre chose que l'algo ?
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@magiraud @mikael-shttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/890... sauf celles qui sont déjà mises ailleurs ? (nom/prénom/birth/id)2017-04-12T14:32:47+02:00Vidjil Team... sauf celles qui sont déjà mises ailleurs ? (nom/prénom/birth/id)
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#888
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#888https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/889Exporter toutes les infos...2017-04-12T14:32:44+02:00Vidjil TeamExporter toutes les infos...
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#888
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#888https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/913body-block2017-04-11T05:55:53+02:00Vidjil Teambody-blockles clones peuvent se body-block s'ils ont exactement le meme x ou y (prevoir un peu de variation sur la force d'attraction pour les debloquer)
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@Duezles clones peuvent se body-block s'ils ont exactement le meme x ou y (prevoir un peu de variation sur la force d'attraction pour les debloquer)
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@Duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2180Faire au moins un test avec souris et rat2017-02-15T20:00:10+01:00Mathieu GiraudFaire au moins un test avec souris et ratcc @mikael-scc @mikael-sAlgo 2017.03https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1338noms des fichiers .data et .analysis exportés2017-02-01T19:15:11+01:00Vidjil Teamnoms des fichiers .data et .analysis exportés
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#1332
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#1332https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1337nom du fichier .csv2017-02-01T19:15:05+01:00Vidjil Teamnom du fichier .csv
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#1332
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#1332https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1334page des fichiers fasta d'un patient2017-02-01T19:15:02+01:00Vidjil Teampage des fichiers fasta d'un patient
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#1332
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#1332https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1333nom du patient transféré dans le .analysis (et affiché dans le info)2017-02-01T19:14:58+01:00Vidjil Teamnom du patient transféré dans le .analysis (et affiché dans le info)
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#1332
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#1332https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1336(et le backdoor du search, mais ok)2017-02-01T19:14:23+01:00Vidjil Team(et le backdoor du search, mais ok)
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#1332
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#1332https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1335export pdf2017-02-01T19:14:13+01:00Vidjil Teamexport pdf
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#1332
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#1332https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1109Il ne semble pas y avoir de message d'erreur lorsque l'upload ne fonctionne pas2017-01-11T15:37:57+01:00Vidjil TeamIl ne semble pas y avoir de message d'erreur lorsque l'upload ne fonctionne pastoujours d'actualité ?
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@Dueztoujours d'actualité ?
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@Duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1264Réuploader un fichier garde le nom d'origine2017-01-05T10:06:49+01:00Vidjil TeamRéuploader un fichier garde le nom d'origineLorsqu'on réuploade un fichier pour remplacer un mauvais fichier par le bon, le nom n'est pas modifié. Ça se discute, mais est-ce réellement souhaitable : j'uploade un fichier toto.fastq mais je conserve le nom tata.fastq, qui était le n...Lorsqu'on réuploade un fichier pour remplacer un mauvais fichier par le bon, le nom n'est pas modifié. Ça se discute, mais est-ce réellement souhaitable : j'uploade un fichier toto.fastq mais je conserve le nom tata.fastq, qui était le nom du fichier uploadé à l'origine. Cela peut être déroutant.
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@nobodyhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1583Makefile: ne pas regénérer vidjil et align.cgi quand pas besoin2016-11-29T14:38:13+01:00Vidjil TeamMakefile: ne pas regénérer vidjil et align.cgi quand pas besoinMême sans rien modifier, un make refait toujours vidjil et align.cgi
- vidjil.o: c'est à cause de git-version.h, qui est toujours regénéré même si cela n'a pas changé
- align.cgi : je ne sais aps
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ab1e8ea: git-version.h.
Il reste le...Même sans rien modifier, un make refait toujours vidjil et align.cgi
- vidjil.o: c'est à cause de git-version.h, qui est toujours regénéré même si cela n'a pas changé
- align.cgi : je ne sais aps
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ab1e8ea: git-version.h.
Il reste les exécutables vidjil et align.cgi
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e04751b et 9f3e2d8
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@nobodyhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1529should_get : * est parfois shell-étendu2016-11-29T14:37:30+01:00Vidjil Teamshould_get : * est parfois shell-étendu$ ok
1: bla.* 0
$ fait une extension (shell) du .*
1: bla .* 0
est-ce normal ?
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Tu l'as corrigé par 83167c9 ?
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Oui, d'ailleurs c'était une extension uniquement dans l'output (ça n'impactait pas la regex).
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@mikael-s$ ok
1: bla.* 0
$ fait une extension (shell) du .*
1: bla .* 0
est-ce normal ?
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Tu l'as corrigé par 83167c9 ?
***
Oui, d'ailleurs c'était une extension uniquement dans l'output (ça n'impactait pas la regex).
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@mikael-shttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1516Color by locus2016-11-29T14:37:21+01:00Vidjil TeamColor by locusMarc, dans 1fcc4967, tu avais commenté "color by locus". Y-avait-il une raison particulière ?
Je l'ai remis, et cela a l'air de bien fonctionner.
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et aussi cluster ? à voir
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On va dire que c'est bon
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@DuezMarc, dans 1fcc4967, tu avais commenté "color by locus". Y-avait-il une raison particulière ?
Je l'ai remis, et cela a l'air de bien fonctionner.
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et aussi cluster ? à voir
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On va dire que c'est bon
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@Duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1444Se passer de org-babel-tangle ?2016-11-29T14:36:24+01:00Vidjil TeamSe passer de org-babel-tangle ?1702465: cela passe aussi sur Travis, et apparament cela passait déjà sur Jenkins.
Franchement, very very low. On pourrait
- mettre un message "the tests also require the org-mode package", et on s'en sort ainsi,
- ou bien ne pas lan...1702465: cela passe aussi sur Travis, et apparament cela passait déjà sur Jenkins.
Franchement, very very low. On pourrait
- mettre un message "the tests also require the org-mode package", et on s'en sort ainsi,
- ou bien ne pas lancer le test si la commande n'est pas dispo. Peut-être plus propre, tu ne voulais pas faire une dépendance aux should_get ?
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merci Mikaël
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@mikael-s