vidjil issueshttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues2017-11-24T11:05:20+01:00https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1920Retour à l'utilisateur lorsque la requête prend un peu de temps2017-11-24T11:05:20+01:00Vidjil TeamRetour à l'utilisateur lorsque la requête prend un peu de tempsÀ partir de quelques dixièmes de seconde, afficher « Loading » en haut de la page, puis au bout de une seconde « Still loading » avec un fond un peu plus voyant. Cela ne changera rien aux timeouts, mais cela devrait éviter que les utilis...À partir de quelques dixièmes de seconde, afficher « Loading » en haut de la page, puis au bout de une seconde « Still loading » avec un fond un peu plus voyant. Cela ne changera rien aux timeouts, mais cela devrait éviter que les utilisateurs appuient de nombreuses fois sur le bouton (en pensant que la requête n'a pas été prise en compte), surchargeant encore plus le serveur.
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@RyanHerbhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1961Sablier / indicateur s'active lors de l'upload2017-11-22T12:49:04+01:00Vidjil TeamSablier / indicateur s'active lors de l'upload
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@RyanHerb
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@RyanHerbRyan HerbertRyan Herberthttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2342Sélection de clones renommés impossible dans la liste2017-11-22T12:49:04+01:00Ghost UserSélection de clones renommés impossible dans la listeUne fois qu'un clone est renommé, il ne semble plus possible de le sélectionner par un clic dans la liste.
La sélection via le graphe ou les cercles fonctionne cependant.
cc @mikael-s @magiraud @RyanHerbUne fois qu'un clone est renommé, il ne semble plus possible de le sélectionner par un clic dans la liste.
La sélection via le graphe ou les cercles fonctionne cependant.
cc @mikael-s @magiraud @RyanHerbhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2402Mise à jour des checkboxes dans le menu settings2017-11-22T12:49:04+01:00Ghost UserMise à jour des checkboxes dans le menu settings![](http://i.imgur.com/LcNWET2.png)
Lorsqu'on clique sur une option, dans le rectangle gris mais pas sur le texte (ici 'length'), l'effet est mis à jour et appliqué mais ce n'est pas le cas des checkboxes.
En cliquant directement s...![](http://i.imgur.com/LcNWET2.png)
Lorsqu'on clique sur une option, dans le rectangle gris mais pas sur le texte (ici 'length'), l'effet est mis à jour et appliqué mais ce n'est pas le cas des checkboxes.
En cliquant directement sur le mot, le fonctionnement est correct (et directement sur les checkboxes aussi bien entendu).Web 2017.05https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2698Multiple scatterplots: export et raccourcis claviers devraient concerner celu...2017-11-20T01:28:28+01:00Mathieu GiraudMultiple scatterplots: export et raccourcis claviers devraient concerner celui du basVu hier avec @mikael-s.Vu hier avec @mikael-s.Web 2017.11https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2724Autocomplete tags : plutôt 7-8 entrées que 5 ?2017-11-18T12:24:04+01:00Mathieu GiraudAutocomplete tags : plutôt 7-8 entrées que 5 ?Rien que avec `ALL`, on voit trop peu de tags.
Un peu plus, 7-8 ? Beaucoup plus (bof, lourd ?) #2118
Quelles sont les bonnes pratiques ?
cc @RyanHerbRien que avec `ALL`, on voit trop peu de tags.
Un peu plus, 7-8 ? Beaucoup plus (bof, lourd ?) #2118
Quelles sont les bonnes pratiques ?
cc @RyanHerbWeb 2017.11https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1765clone.js, .getShortName() : setting pour afficher ou non les séquences2017-11-15T17:01:09+01:00Vidjil Teamclone.js, .getShortName() : setting pour afficher ou non les séquences
@mikael-s : "pas très lisible, tous ces chiffres."
On pourrait aussi afficher de temps en temps des séquences... si elles ne sont pas trop longues.
Par exemple 6/AAT/5, 6/AACAGT/7, 6/AACT...(12)/5
Et controller tout cela par un ...
@mikael-s : "pas très lisible, tous ces chiffres."
On pourrait aussi afficher de temps en temps des séquences... si elles ne sont pas trop longues.
Par exemple 6/AAT/5, 6/AACAGT/7, 6/AACT...(12)/5
Et controller tout cela par un paramètre.
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Au passage, Lille voudrait voir -6/3/-5, mais on ne va pas faire cela pour l'instant.
https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1015Épaisseur de la police2017-11-15T08:32:46+01:00Vidjil TeamÉpaisseur de la policeok sur Chrome, légèrement trop gras sur Firefox / Safari ?
Tests à faire, à voir
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@nobodyok sur Chrome, légèrement trop gras sur Firefox / Safari ?
Tests à faire, à voir
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@nobodyhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2671Tags : sensibilité à la casse2017-10-19T11:26:52+02:00Mikaël SalsonTags : sensibilité à la casseDiscuté avec @RyanHerb : les tags ne devraient probablement pas être sensibles à la casse (c'est-à-dire que mettre un #LAL ou un #lal est équivalent : cela pointe sur la même entrée dans la DB).
Même si on pourrait imaginer des usages o...Discuté avec @RyanHerb : les tags ne devraient probablement pas être sensibles à la casse (c'est-à-dire que mettre un #LAL ou un #lal est équivalent : cela pointe sur la même entrée dans la DB).
Même si on pourrait imaginer des usages où la casse serait importante, les utilisateurs ne vont pas forcément faire attention à cette subtilité-là. S'ils se mettent d'accord pour utiliser un tag #LAL, ils ne vont pas forcément préciser entre eux la casse que le tag devrait avoir.Ryan HerbertRyan Herberthttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1546Rechercher sur le brin complémentaire aussi / revcomp2017-07-10T17:01:50+02:00Vidjil TeamRechercher sur le brin complémentaire aussi / revcompDans la box search sur la liste.
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Relativement simple et utile !
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list.js:704, fonction filter()
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Je viens de faire la fonction. Je l'ai pusher sur master (je n'y ai pas repensé).
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ok... mais pourquoi une accolade a sauté dan...Dans la box search sur la liste.
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Relativement simple et utile !
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list.js:704, fonction filter()
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Je viens de faire la fonction. Je l'ai pusher sur master (je n'y ai pas repensé).
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ok... mais pourquoi une accolade a sauté dans list.js ? J'ai l'impression que cela ne passe plus tout à fait :)
Au fait, tu peux faire, pour revoir ton commit : git show 5c43ecaf
(Et c'est conseillé d'installer / utiliser gitk pour voir les commits)
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un fausse manip sur un copié-collé.
Corrigé.
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Super ! Idéalement, il faudrait faire un test.
Voir browser/test/QUnit/testFiles.list_test.js, ligne 85
list.filter("test2")
Le test est pour l'instant uniquement sur le nom du clone, il faudrait qu'il y en ait un sur la séquence, et un autre sur la séquence en revcomp (Les clones de test sont définis dans data_test.js).
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@flothonihttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1131Filtrage dynamique des patients2017-07-10T17:01:30+02:00Vidjil TeamFiltrage dynamique des patientsLa table des patients risque d'être longue. Il sera utile de pouvoir filtrer par nom, par info. Ajouter une barre en haut pour pouvoir conserver (dynamiquement) les patients qui matchent.
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Je pensais aussi à un tri (par nom ? par date...La table des patients risque d'être longue. Il sera utile de pouvoir filtrer par nom, par info. Ajouter une barre en haut pour pouvoir conserver (dynamiquement) les patients qui matchent.
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Je pensais aussi à un tri (par nom ? par date ?), mais le filtrage est bien mieux.
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5a3dddb. Merci Marc, excellent
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@Duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2037Pagination de la requête patient/sample_set2017-07-10T17:01:30+02:00Ryan HerbertPagination de la requête patient/sample_setLa requête patient est lente (#1542).
Une solution est de paginer les résultats.
Les problèmes relevés sont que les données supplémentaires sont calculés dans des requêtes secondaires, et donc les fonctions de filtre et de sort ne ...La requête patient est lente (#1542).
Une solution est de paginer les résultats.
Les problèmes relevés sont que les données supplémentaires sont calculés dans des requêtes secondaires, et donc les fonctions de filtre et de sort ne peuvent pas fonctionner correctement avec la pagination.
La solution proposée était de désactiver la pagination lors du filtre ou du sort des résultats
@RyanHerb @magiraud @mikael-s Web 2017.03Ryan HerbertRyan Herberthttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1392filter pourrait aussi reconnaître un "-"2017-07-10T17:01:29+02:00Vidjil Teamfilter pourrait aussi reconnaître un "-"La nouveauté "multi words" dans le champ filter m'a fait penser à un truc :
Le champ filter dans les tableaux (patients, log, ...) pourrait accepter "-blabla" pour n'afficher que les lignes sans "blabla". Et on voudrait pouvoir faire "bl...La nouveauté "multi words" dans le champ filter m'a fait penser à un truc :
Le champ filter dans les tableaux (patients, log, ...) pourrait accepter "-blabla" pour n'afficher que les lignes sans "blabla". Et on voudrait pouvoir faire "bli blo -blabla -blublu"
En fait, cela vient du log, sur le serveur je fais quasiment toujours un "grep -v team" et puis d'autres "grep -v" pour filtrer ce que je connais.
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merci !
(et Marc, tu peux fermer les tâches quand c'est le cas)
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@Duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2064Sélectionner un rectangle sur une vue histogramme2017-07-10T17:01:29+02:00Mathieu GiraudSélectionner un rectangle sur une vue histogrammeSur la grid, on peut simplement sélectionner plusieurs clones par un rectangle (modulo #971).
Ce serait fantastique de pouvoir faire la même chose sur un histogramme. Soit directement sur les clones, soit éventuellement en cliquant sur ...Sur la grid, on peut simplement sélectionner plusieurs clones par un rectangle (modulo #971).
Ce serait fantastique de pouvoir faire la même chose sur un histogramme. Soit directement sur les clones, soit éventuellement en cliquant sur l'axe x.
On pourrait ainsi, dans une vue "à la GeneScan", sélectionner / filtrer (par `focus`) un pic et analyser des choses dessus.
Voir aussi #2059.
@aurelBZH @flothoni @RyanHerb @mikael-shttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1054Filtrage par nom, par séquence en nt2017-07-10T17:01:29+02:00Vidjil TeamFiltrage par nom, par séquence en ntNécessite déjà d'avoir calculé la séquence en aa…
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Une boite 'filter' unique dans #list_menu, qui permet de temporairement filtrer (même chose que tag visibiliter) tous les clones (que ce soit dans la liste, le scatter ou le graphe)
...Nécessite déjà d'avoir calculé la séquence en aa…
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Une boite 'filter' unique dans #list_menu, qui permet de temporairement filtrer (même chose que tag visibiliter) tous les clones (que ce soit dans la liste, le scatter ou le graphe)
Idéalement, il faudrait pouvoir rentrer dans la boîte un texte libre (pas besoin d'autocomplétion), qui filtre en même temps sur tous les champs.
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merci Marc, vive le travail en gare !
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(par AA, mis dans une autre tâche)
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Juste pour chipoter : on peut avoir un filtrage en temps réel ? (sans besoin de valider ?)
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hihihi, Marc le voulait aussi, c'est moi qui était pas super partant (que se passe-t-il si cela rame (balayage de tous les clones pour chaque caractère) ?
Scénario : cela rame, on entre 10 caractères... et on le voit ramer pour filtrer 1 caractère après l'autre Ou serait-il capable d'interrompre les trucs précédents ?
Je m'incline si cela ne rame vraiment pas (sur l'ordi de Nathalie :)
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#1055, #1056, #1057, #1058
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@Duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1055Filtrage par nom "V5"2017-07-10T17:01:29+02:00Vidjil TeamFiltrage par nom "V5"
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#1054
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#1054https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1056Filtrage par nom customisé "stand"2017-07-10T17:01:29+02:00Vidjil TeamFiltrage par nom customisé "stand"
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#1054
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#1054https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1057Filtrage par séquence nt "ATATACAGT"2017-07-10T17:01:29+02:00Vidjil TeamFiltrage par séquence nt "ATATACAGT"
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#1054
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#1054https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1058Filtrage par séquence aa "KVIL" (plus tard, quand on aura les AA)2017-07-10T17:01:29+02:00Vidjil TeamFiltrage par séquence aa "KVIL" (plus tard, quand on aura les AA)
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#1054
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#1054https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2390Désélection du clone lors d'un clic sur la taille dans le segmenteur2017-06-15T13:13:03+02:00Ghost UserDésélection du clone lors d'un clic sur la taille dans le segmenteurRemarqué il y a quelques temps ; c'est un comportement assez étrange mais manifestement volontaire puisque le code qui en est la cause est assez explicite :
```js
div_elem.getElementsByClassName("sizeBox")[0]
.onclick = function (...Remarqué il y a quelques temps ; c'est un comportement assez étrange mais manifestement volontaire puisque le code qui en est la cause est assez explicite :
```js
div_elem.getElementsByClassName("sizeBox")[0]
.onclick = function (e) {
clone.unselect();
}
```
et identique à celui de la `delBox` (la croix à gauche).
Deux questions donc :
- est-ce bien un fonctionnement prévu ?
- si oui, faut-il le maintenir sur toutes les `axisBox` qui vont se trouver à cet endroit ?Web 2017.05