vidjil issueshttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues2021-04-14T08:41:06+02:00https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/3243Export des informations d'un clone2021-04-14T08:41:06+02:00Mikaël SalsonExport des informations d'un cloneLe tableau d'information d'un clone peut être affiché mais ne peut pas être exporté. Or beaucoup d'informations s'y trouvent (y compris provenant d'IMGT le cas échéant) et il serait intéressant de ne pas les perdre (cf. #3241).Le tableau d'information d'un clone peut être affiché mais ne peut pas être exporté. Or beaucoup d'informations s'y trouvent (y compris provenant d'IMGT le cas échéant) et il serait intéressant de ne pas les perdre (cf. #3241).https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/3199Bug lors de l'ajout de samples à plusieurs patients2018-06-13T09:33:58+02:00Mikaël SalsonBug lors de l'ajout de samples à plusieurs patientsRapporté par ~"LIL-Lille" :
>Hier j’ai chargé 2 runs de 20 éch dans le cadre d’un test et en regardant ce matin, j’ai constaté tout de suite qu’il y a eu un souci : le patient qui contient le 1er échantillon a eu aussi tous les autres al...Rapporté par ~"LIL-Lille" :
>Hier j’ai chargé 2 runs de 20 éch dans le cadre d’un test et en regardant ce matin, j’ai constaté tout de suite qu’il y a eu un souci : le patient qui contient le 1er échantillon a eu aussi tous les autres alors que j’ai bien attribué un éch = un patient. En regardant au niveau du run, je me suis aperçue qu’il conservait l’historique des patients et donc incrémente à chaque fois la liste. J’ai mis une impression écran pour mieux me faire comprendre.
J'ai aussi essayé :
1. Création d'un run vide
2. Création de 4 patients vides
3. Upload de 4 samples dans le run en attribuant chaque sample à un seul patient
Le premier patient se retrouve avec les 4 samples, le 2è avec 3, le 3è avec 2 et le dernier avec 1.https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/3128Point caché (dans l'épingle) qui apparaît malgré tout dans le graphique2022-05-12T11:12:09+02:00Mikaël SalsonPoint caché (dans l'épingle) qui apparaît malgré tout dans le graphiqueSignalé par ~"LIL-Lille".
Il y a 3 points pour un patient mais 1 a été caché manuellement. Après avoir fait un compare patients, en retournant voir les résultats de ce patient, le 3è apparait comme fantôme (ou une copie du 1er ?) à la 2è...Signalé par ~"LIL-Lille".
Il y a 3 points pour un patient mais 1 a été caché manuellement. Après avoir fait un compare patients, en retournant voir les résultats de ce patient, le 3è apparait comme fantôme (ou une copie du 1er ?) à la 2è position.
@Aurelie va nous envoyer le lien.https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/3100Autocomplete : vitesse/latence en production2018-06-26T15:01:25+02:00Mathieu GiraudAutocomplete : vitesse/latence en productionVu ensemble lors du test de déploiement : il y avait des reqûetes > 100 secondes pour l'autocomplete
- pour tous, 500 est quasi bon... quitte à attendre si on en veut plus, après quelques caractères ?
- pour les admins, limite spécifi...Vu ensemble lors du test de déploiement : il y avait des reqûetes > 100 secondes pour l'autocomplete
- pour tous, 500 est quasi bon... quitte à attendre si on en veut plus, après quelques caractères ?
- pour les admins, limite spécifique ?
Demande à chaque caractère ? Danger de lag ? Un truc asynchrone ?
Bloque vdj#626.
cc @flothoni @RyanHerbRyan HerbertRyan Herberthttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/3078L'application client se fige de manière aléatoire2018-04-05T09:51:09+02:00Mikaël SalsonL'application client se fige de manière aléatoireRemonté par @Aurelie :
> la page se fige, plus aucune fonction ne répond. Là il faut que je vide l’historique et que je me reconnecte à Vidjil pour que cela reparte.
Et :
>
Pour les pages qui se figent, c’est reproductible et je pens...Remonté par @Aurelie :
> la page se fige, plus aucune fonction ne répond. Là il faut que je vide l’historique et que je me reconnecte à Vidjil pour que cela reparte.
Et :
>
Pour les pages qui se figent, c’est reproductible et je pense que cela se passe uniquement sur les pages d’analyses. Je n’ai pas le souvenir que ce se soit produit quand on est sur la page de la base patients ou quand on crée un nouveau dossier patient.
Peut-être lié à #2847, à voir lorsqu'il sera résolu.https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/3063conserver le path lors du chargement de plusieurs fichiers2018-03-05T16:54:28+01:00Thonier Florianconserver le path lors du chargement de plusieurs fichiersAurélie qui semble utiliser le chargement directement depuis le serveur ne conserve pas le chemin relatif précédent à ses anciens chargements. Plus précisément, lors du chargement de chaque fichier, elle doit dérouler l'ensemble de son a...Aurélie qui semble utiliser le chargement directement depuis le serveur ne conserve pas le chemin relatif précédent à ses anciens chargements. Plus précisément, lors du chargement de chaque fichier, elle doit dérouler l'ensemble de son arborescence pour retrouver le nouveau fichier à uploader (à priori 7 sous-dossiers a traverser).
Je ne sais pas quelle serait la meilleur solution.
* On peut conserver dans la session le chemin relative au chargement précédent et le précharger dans le `jstree` ?
* Autre point, si on connaît le dossier à partir duquel tous les fichiers sont chargés, on peut modifier le point de montage par défaut pour qu'il pointe dessus, mais pour ça il faut que tous les fichiers a charger proviennent de ce dossier.
cc @RyanHerb @mikael-s @magiraudhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2952My Account: informations sur les groupes2020-11-18T16:50:43+01:00Mathieu GiraudMy Account: informations sur les groupesExtrait de #1682.
Après #2951 :
@RyanHerb : Je pensais effectivement plus à une page fournie par un contrôleur du type "My Account", et l'idée d'afficher les permissions et donc aussi les appartenances aux groupes pourrait être une bon...Extrait de #1682.
Après #2951 :
@RyanHerb : Je pensais effectivement plus à une page fournie par un contrôleur du type "My Account", et l'idée d'afficher les permissions et donc aussi les appartenances aux groupes pourrait être une bonne idée, surtout avec les labos qui commencent à nous demander des groupes pour partager les données.https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2948Conserver le chemin précédent lors du chargement d'un fichier 'network'2018-03-21T11:44:38+01:00Ryan HerbertConserver le chemin précédent lors du chargement d'un fichier 'network'Repartir de la racine du stockage peut impliquer beaucoup de clics peut être fastidieux, ce serait bien de se souvenir du dernier chemin emprunté.
Demande de @AurelieRepartir de la racine du stockage peut impliquer beaucoup de clics peut être fastidieux, ce serait bien de se souvenir du dernier chemin emprunté.
Demande de @AurelieRyan HerbertRyan Herberthttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2942Bug lors de la génération de rapport2018-03-05T17:16:25+01:00Mikaël SalsonBug lors de la génération de rapport~"Paris - St Louis"
>
je rencontre aujourd'hui des difficultés pour exporter les rapports de séquence depuis Vidjil. Quand j'exporte le rapport avec le mode "export report/sample", la fiche est incomplète, il manque la ou les séquences ...~"Paris - St Louis"
>
je rencontre aujourd'hui des difficultés pour exporter les rapports de séquence depuis Vidjil. Quand j'exporte le rapport avec le mode "export report/sample", la fiche est incomplète, il manque la ou les séquences sélectionnée-s (Cf pièces-jointes). Ensuite le logiciel reste figé avec le message "generating report".
>
Je dois alors me déconnecter pour revenir à la liste des patients. J'ai tout de même réussi à réaliser quelques report sans problème, mais cette anomalie revient souvent.
Problèmes remontés par ~"LIL-Lille" aussi.
La génération des rapports est normalement testée.https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2929Avoir l'abondance des clones dans les résultats de la CloneDB2018-07-26T13:58:33+02:00Mikaël SalsonAvoir l'abondance des clones dans les résultats de la CloneDBC'est @magiraud qui avait dit cela (de mémoire cela venait de Lille). Ce serait effectivement pertinent de savoir à quelle concentration était le clone vu dans un autre échantillon.C'est @magiraud qui avait dit cela (de mémoire cela venait de Lille). Ce serait effectivement pertinent de savoir à quelle concentration était le clone vu dans un autre échantillon.Alexia OmietanskiAlexia Omietanskihttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2876Exporter l'alignement2019-02-28T16:46:15+01:00Mathieu GiraudExporter l'alignementÉvoqué par Fred ~"Paris-Pitié" : pourrait-on exporter l'alignement du segmenteur ?
(Et/ou jouer avec dans Vidjil ?)Évoqué par Fred ~"Paris-Pitié" : pourrait-on exporter l'alignement du segmenteur ?
(Et/ou jouer avec dans Vidjil ?)https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2847Problème avec align quand on change de patient : `this.sequence` dans Segmen...2018-04-05T09:51:21+02:00Thonier FlorianProblème avec align quand on change de patient : `this.sequence` dans Segmenter n'est pas mise à jourUne remarque de ~"LIL-Lille" : de temps en temps, la fonction alignement ne fonctionne pas. Je présume qu'il doit s'agir d'un problème dnas l'accès au fichier CGI, ou bien d'un timeout dependant de leur réseau. Il faudrait avoir un log q...Une remarque de ~"LIL-Lille" : de temps en temps, la fonction alignement ne fonctionne pas. Je présume qu'il doit s'agir d'un problème dnas l'accès au fichier CGI, ou bien d'un timeout dependant de leur réseau. Il faudrait avoir un log qui correspond dans ce cas.
Sinon, rechercher l'origine de l'erreur, mais a priori completement aléatoire.https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2840A quoi sert le bouton tag visibility ?2018-02-16T12:10:55+01:00Thonier FlorianA quoi sert le bouton tag visibility ?En dessous du slider de filter clone, nous avons un boutton `tag visibility`.
A priori il n'y a aucune action attachée à ce bouton, et aucun effet si on clique dessus.
S'agit-il d'une reminiscence du passé ou est-il sensé avoir une fo...En dessous du slider de filter clone, nous avons un boutton `tag visibility`.
A priori il n'y a aucune action attachée à ce bouton, et aucun effet si on clique dessus.
S'agit-il d'une reminiscence du passé ou est-il sensé avoir une fonction. Si tel est le cas, il n'est pas forcement très explicite.https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2743Passer avec la souris sur les séquences du segmenteur supprime la vue des mut...2022-05-12T11:06:47+02:00Mathieu GiraudPasser avec la souris sur les séquences du segmenteur supprime la vue des mutationsRapporté par Aurélie ~"LIL-Lille" ce matin: lors d'un certain `:hover`, la couleur rouge s'enlève.
Je ne suis pas sûr d'avoir bien compris, je n'ai pas réussi à reproduire de mon côté.
@RyanHerb avait des idées à ce propos (update du se...Rapporté par Aurélie ~"LIL-Lille" ce matin: lors d'un certain `:hover`, la couleur rouge s'enlève.
Je ne suis pas sûr d'avoir bien compris, je n'ai pas réussi à reproduire de mon côté.
@RyanHerb avait des idées à ce propos (update du segmenteur et highlights ?)https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2605Admin: Liste des jobs en attente, en cours depuis l'interface admin2020-11-18T16:50:48+01:00Thonier FlorianAdmin: Liste des jobs en attente, en cours depuis l'interface adminJe vois à l'instant qu'il y a 30 jobs en attente.
De l'autre côté, Aurélie me dit que son job est long a se lancer, et qu'elle est préssée à cause de la fermeture du serveur lundi et mardi.
Cependant, je ne peux pas dire depuis l'inte...Je vois à l'instant qu'il y a 30 jobs en attente.
De l'autre côté, Aurélie me dit que son job est long a se lancer, et qu'elle est préssée à cause de la fermeture du serveur lundi et mardi.
Cependant, je ne peux pas dire depuis l'interface si son jobs va se lancer prochainement ou à la fin de la liste.
@magiraud @mikael-s @RyanHerbhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2536Faut-il maintenir un groupe vide2017-06-15T14:58:37+02:00Thonier FlorianFaut-il maintenir un groupe videVoilà le situation actuelle :
Un hôpital à 2 groupes, ingénieurs (avec l'ensemble des droits) et techniciens (sans le droits de sauvegarder les analyses)
Le premier comporte plusieurs membres, le second un seul.
On me demande de donne...Voilà le situation actuelle :
Un hôpital à 2 groupes, ingénieurs (avec l'ensemble des droits) et techniciens (sans le droits de sauvegarder les analyses)
Le premier comporte plusieurs membres, le second un seul.
On me demande de donner tous les droits à ce dernier membre. La question est donc de savoir si il vaut mieux que je déplace ce membre dans le groupe ingé qui ont tous les droits, et laisser un groupe vide derrière moi, ou bien de donner le droit manquant à ce second groupe, mais poser des soucis si un nouveau membre s'y rajoute.
Perso, je penche pour la première option. Vous êtes d'accord ?
@mikael-s @magiraudhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2525"Vidjil is loading": Le bouton login fonctionne-t-il du premier coup ?2018-04-13T15:56:03+02:00Mathieu Giraud"Vidjil is loading": Le bouton login fonctionne-t-il du premier coup ?Aurélie nous signale qu'elle doit parfois cliquer deux fois pour s'identifier... (et j'ai aussi parfois cette impression, sans être vraiment sûr). Est-ce en lien avec #1113 ?
Ou avec des lenteurs du serveur ? Dans ce cas, faire un reto...Aurélie nous signale qu'elle doit parfois cliquer deux fois pour s'identifier... (et j'ai aussi parfois cette impression, sans être vraiment sûr). Est-ce en lien avec #1113 ?
Ou avec des lenteurs du serveur ? Dans ce cas, faire un retour à l'utilisateur qu'un chargement est en cours ?
cc @RyanHerbhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2373Coloration des clones dans le rapport monitreur2017-04-14T13:18:06+02:00Ryan HerbertColoration des clones dans le rapport monitreurAurélie nous dit qu'elle voudrait avoir une meilleure coloration des clones dans le rapport moniteur car elle ne s'y retrouve pas toujours.
Deux propositions:
- enlever la coloration par locus du pie chart pour colorier les clones sans...Aurélie nous dit qu'elle voudrait avoir une meilleure coloration des clones dans le rapport moniteur car elle ne s'y retrouve pas toujours.
Deux propositions:
- enlever la coloration par locus du pie chart pour colorier les clones sans créer d'incohérence
- tout colorier par locus.https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2297CGI d'alignement introuvable en https2017-06-07T13:53:56+02:00Thonier FlorianCGI d'alignement introuvable en httpsBug découvert par Aurélie Caillault-Vennet:
En fonction de l'accès en http ou https, le CGI de l'alignement est introuvable.
De plus, dans mon cas, j'ai un pop-up qui me l'indique, et dans le cas de Lille la machine se met a mouliner...Bug découvert par Aurélie Caillault-Vennet:
En fonction de l'accès en http ou https, le CGI de l'alignement est introuvable.
De plus, dans mon cas, j'ai un pop-up qui me l'indique, et dans le cas de Lille la machine se met a mouliner. J'attends confirmation pour ce second point
cc @RyanHerb @mikael-s @magiraudMikaël SalsonMikaël Salsonhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2160Ajouter un clone: interface utilisateur et appel au segmenteur2017-03-01T08:33:03+01:00Mathieu GiraudAjouter un clone: interface utilisateur et appel au segmenteurSuite à #1921 :
* [x] interface utilisateur, un popup quelque part
* [x] lancer ~"segmenter-app" pour peupler le .js du clone en question
@mikael-s @RyanHerbSuite à #1921 :
* [x] interface utilisateur, un popup quelque part
* [x] lancer ~"segmenter-app" pour peupler le .js du clone en question
@mikael-s @RyanHerbArmand BourArmand Bour