vidjil issueshttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues2018-07-12T10:07:54+02:00https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/1461mettre une rangée d'étoiles dans le .info_color et dans le menu "filter" pour...2018-07-12T10:07:54+02:00Vidjil Teammettre une rangée d'étoiles dans le .info_color et dans le menu "filter" pour les tagsLes carrés des tags se confondent trop avec ceux des locus (oui je sais, c'est ma faute, j'ai réduit leur taille).
Mettre des étoiles partout serait cohérent.
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@DuezLes carrés des tags se confondent trop avec ceux des locus (oui je sais, c'est ma faute, j'ai réduit leur taille).
Mettre des étoiles partout serait cohérent.
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@Duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2060Afficher la documentation des axes2023-03-01T18:19:49+01:00Mathieu GiraudAfficher la documentation des axesDans `available_axis` (pour l’instant dans `scatterplot.js`), avoir pour chaque axe, une documentation / commentaire en ~1 ligne. Cela aiderait en particulier pour les choses obscures comme « coverage » et autres :-)
Cette doc serait vi...Dans `available_axis` (pour l’instant dans `scatterplot.js`), avoir pour chaque axe, une documentation / commentaire en ~1 ligne. Cela aiderait en particulier pour les choses obscures comme « coverage » et autres :-)
Cette doc serait visible en ` :hover` :
- dans le choix des axes x/y dans le sous-menu plot
- sur la grid, sur la légende
- et potentiellement à d'autres endroits une fois qu'on aura #1471
@mikael-s @RyanHerb
* [x] Rajouter un champ `.doc` dans certains axes
* [ ] Implémenter le `:hover`, déjà sur la grid, dans la légendehttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/3126Rapport : date de naissance + autres infos du patient (run/set) ?2021-01-26T15:19:10+01:00Mathieu GiraudRapport : date de naissance + autres infos du patient (run/set) ?On a vu au moins un rapport de ~"LIL-Lille" sans infos du patient (date de naissance...)On a vu au moins un rapport de ~"LIL-Lille" sans infos du patient (date de naissance...)Lille-LAL-nexthttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/3440repetition d'un warning de clone présent sur plusieurs sample : simplifier, f...2020-12-04T14:10:31+01:00Thonier Florianrepetition d'un warning de clone présent sur plusieurs sample : simplifier, factoriserCas ici: https://app.vidjil.org/browser/?set=28565&config=25
On peux voir qu'un clone a un warning `w61: non recombiné...`. Mais comme le clone est présent sur chaque sample, on a une répétion de celui-ci de multiple fois, au survol de ...Cas ici: https://app.vidjil.org/browser/?set=28565&config=25
On peux voir qu'un clone a un warning `w61: non recombiné...`. Mais comme le clone est présent sur chaque sample, on a une répétion de celui-ci de multiple fois, au survol de l’icône, ou bien aussi lors de l'affichage détaillé du clone.
Je ne sais pas si tous les warning devrait être concerné, mais une tel répétition dans ce cas présent est inutile.https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/3669Impossible de modifier les permissions d'un groupe2020-02-11T18:19:59+01:00Mikaël SalsonImpossible de modifier les permissions d'un groupeDans la page des groupes, lorsque je clique sur une icône des permissions (la clé), une requête est envoyée au contrôleur `group/permissions` qui produit une erreur 404. Le contrôleur existe bien, en revanche il n'y a pas de vue `views/g...Dans la page des groupes, lorsque je clique sur une icône des permissions (la clé), une requête est envoyée au contrôleur `group/permissions` qui produit une erreur 404. Le contrôleur existe bien, en revanche il n'y a pas de vue `views/groups/permissions.html`. J'ignore si c'est cela qui produit l'erreur 404, mais il ne semble pas y avoir eu de modifications récentes dans `views/`.
@flothoni je vois que tu as attribué des permissions début décembre, est-ce que cela fonctionnait correctement ? Comment as-tu fait ? Est-ce que cela fonctionne toujours pour toi ?https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/3685algo: sortir {} dans le .vidjil quand il n'y a pas de clones2019-12-03T08:52:30+01:00Mathieu Giraudalgo: sortir {} dans le .vidjil quand il n'y a pas de clonesSuite à #3555 / !329
Sortir `clones: {}` au lieu de `clones: null`.
Suite à #3555 / !329
Sortir `clones: {}` au lieu de `clones: null`.
https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/3687Champ de recherche sur la page d'un sample set : utiliser l'autocomplétion2019-02-28T12:38:04+01:00Mikaël SalsonChamp de recherche sur la page d'un sample set : utiliser l'autocomplétionL'autocomplétion est disponible lorsqu'on ajoute un sample à un sample set en revanche si on cherche tout simplement un sample set précis qu'on veut consulter, il n'y a pas d'autocomplétion.
C'est dommage, et j'imagine que l'effort devra...L'autocomplétion est disponible lorsqu'on ajoute un sample à un sample set en revanche si on cherche tout simplement un sample set précis qu'on veut consulter, il n'y a pas d'autocomplétion.
C'est dommage, et j'imagine que l'effort devrait être minime pour avoir accès également à cette autocomplétion.https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/3725Savoir si une germline est incomplète ou pas ?2019-02-12T14:03:15+01:00Mathieu GiraudSavoir si une germline est incomplète ou pas ?Il y a des occurrences de `code.find("+")` dans `core/germlines.cpp` et dans `core/segment.cpp` (et 5bc753ee).
Avoir explicitement un attribut `Germlines.regular` ?
Voir vieille tâche #2153 ? Dépassé par #1169 voire #3377 ?Il y a des occurrences de `code.find("+")` dans `core/germlines.cpp` et dans `core/segment.cpp` (et 5bc753ee).
Avoir explicitement un attribut `Germlines.regular` ?
Voir vieille tâche #2153 ? Dépassé par #1169 voire #3377 ?https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/3739Retirer les `using namespace std`2019-02-14T22:15:55+01:00Mathieu GiraudRetirer les `using namespace std`Vu par #3738.
https://stackoverflow.com/questions/1452721/why-is-using-namespace-std-considered-bad-practice
https://www.geeksforgeeks.org/using-namespace-std-considered-bad-practice/Vu par #3738.
https://stackoverflow.com/questions/1452721/why-is-using-namespace-std-considered-bad-practice
https://www.geeksforgeeks.org/using-namespace-std-considered-bad-practice/https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/3763Extraire des tests 'a' des tests 'f' dans un stage gitlab2019-04-01T11:07:01+02:00Mathieu GiraudExtraire des tests 'a' des tests 'f' dans un stage gitlabSuite à !414 (et potentiellement d'autres tests déjà existants), l'avis d'un expert en test est sollicité sur https://gitlab.inria.fr/vidjil/should/issues/27#note_175709 pour voir si ce serait une solution viable pour mieux suivre ces te...Suite à !414 (et potentiellement d'autres tests déjà existants), l'avis d'un expert en test est sollicité sur https://gitlab.inria.fr/vidjil/should/issues/27#note_175709 pour voir si ce serait une solution viable pour mieux suivre ces tests `a` comme `f`.https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/3869Indiquer si on regarde un run/patient/set (par le background)2019-03-25T12:05:24+01:00Thonier FlorianIndiquer si on regarde un run/patient/set (par le background)Je pense qu'un fond sur le nom du run/set/setting est assez simple à mettre en place.
On pourrait simplement utiliser le même code couleur que pour les patients/runs/sets.Je pense qu'un fond sur le nom du run/set/setting est assez simple à mettre en place.
On pourrait simplement utiliser le même code couleur que pour les patients/runs/sets.https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/4212Afficher le top d'un clone2020-06-10T19:19:52+02:00Mikaël SalsonAfficher le top d'un cloneEn regardant un clone qui apparait dans plusieurs échantillons au cours du temps je voulais connaitre son "top" (son rang) parmi les clones d'un échantillon donné… et on ne l'a pas (même dans la fenêtre info). C'est dommage.En regardant un clone qui apparait dans plusieurs échantillons au cours du temps je voulais connaitre son "top" (son rang) parmi les clones d'un échantillon donné… et on ne l'a pas (même dans la fenêtre info). C'est dommage.https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/4257Pouvoir diminuer le menu filter jusqu'à 12020-04-21T12:25:48+02:00Mikaël SalsonPouvoir diminuer le menu filter jusqu'à 1Le menu filter ne permet de descendre que jusqu'au top 5 mais quand on a beaucoup de samples, ça fait encore beaucoup de lignes dans tous les sens.Le menu filter ne permet de descendre que jusqu'au top 5 mais quand on a beaucoup de samples, ça fait encore beaucoup de lignes dans tous les sens.https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/4294getHTMLInfo et distribution; avoir le nombre de clone non nul du sample2020-05-19T13:38:59+02:00Thonier FloriangetHTMLInfo et distribution; avoir le nombre de clone non nul du sampleJe m'aperçois que lorsque l'on ouvre un clone de distribution, nous avons le nombre de clone non nul recouvert par cet agrégat de clone (ligne `clone name`). Nous n'avons en revanche pas les informations pour les autres échantillons.
A...Je m'aperçois que lorsque l'on ouvre un clone de distribution, nous avons le nombre de clone non nul recouvert par cet agrégat de clone (ligne `clone name`). Nous n'avons en revanche pas les informations pour les autres échantillons.
Ainsi , si nous changeons de sample, nous n'avons pas de mis à jour de cette valeur, nu même si nous changeons le slider de filtre. Une solution serait d'avoir une ligne en plus pour ces clones qui indiquerait cette valeur pour chacun d'entre eux.
En revanche je n'ai pas de solution à par un update du gethtml si on modifie la valeur du slider de filtre.https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/4345Suggérer de recharger le client2020-06-12T20:08:49+02:00Mikaël SalsonSuggérer de recharger le clientLe client devrait détecter qu'il n'est plus à jour et suggérer à l'utilisateur de recharger la page. Mattermost le fait par exemple.
Cela éviterait qu'une utilisatrice se retrouve avec un client vieux de 4 mois car n'ayant pas eu à rech...Le client devrait détecter qu'il n'est plus à jour et suggérer à l'utilisateur de recharger la page. Mattermost le fait par exemple.
Cela éviterait qu'une utilisatrice se retrouve avec un client vieux de 4 mois car n'ayant pas eu à recharger la page depuis (https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/4265#note_350767).https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/4454Index d'overlaps: une seule fonction dans fuse.py ?2020-09-03T17:21:27+02:00Mathieu GiraudIndex d'overlaps: une seule fonction dans fuse.py ?Voir https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/merge_requests/465#note_370823
@mikael-s, ton avis ?
cc @flothoniVoir https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/merge_requests/465#note_370823
@mikael-s, ton avis ?
cc @flothonihttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/4476Set creation should ignore leading/trailing spaces2024-03-27T14:28:29+01:00Mathieu GiraudSet creation should ignore leading/trailing spacesSi je rentre `2020-02-15 ` dans un champ date, avec un espace à la fin, cela ne passe pas au validateur et c'est bloquant.
Cela peut arriver encore plus souvent avec !783
Plus généralement, on pourrait enlever tous les espaces, pour le...Si je rentre `2020-02-15 ` dans un champ date, avec un espace à la fin, cela ne passe pas au validateur et c'est bloquant.
Cela peut arriver encore plus souvent avec !783
Plus généralement, on pourrait enlever tous les espaces, pour les prénoms / noms aussi.marc duezmarc duezhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/4494Avoir des tooltip sur les contenus des différents tableaux2020-09-28T17:12:28+02:00Thonier FlorianAvoir des tooltip sur les contenus des différents tableaux@mikael-s depuis #4493
>et de toute façon sur mon écran je ne vois pas R1/R2 car c'est trop court
J'ai aussi souvent ce cas justement, à plein d'endroit dans les tables. On devrait pouvoir avoir un tooltip au hover (balise `title` en f...@mikael-s depuis #4493
>et de toute façon sur mon écran je ne vois pas R1/R2 car c'est trop court
J'ai aussi souvent ce cas justement, à plein d'endroit dans les tables. On devrait pouvoir avoir un tooltip au hover (balise `title` en fait) qui indique le contenu de la colonne quand on n'a pas la place.
Ce serait déjà une amélioration mineur en attendant de faire une refont du HTML/CSS de ces colonnes (je ne me souviens pas de l'issue correspondante...)https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/4496Avoir un preset locus/size2020-09-29T12:33:01+02:00Mikaël SalsonAvoir un preset locus/sizeUtilisé à l'APHP : leur permet de voir s'il y a une distribution polyclonale selon les locus.Utilisé à l'APHP : leur permet de voir s'il y a une distribution polyclonale selon les locus.https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/4508Dans la table groupe, afficher une colonne `group_id`2021-01-04T09:59:38+01:00Mathieu GiraudDans la table groupe, afficher une colonne `group_id`marc duezmarc duez