vidjil issueshttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues2022-06-29T13:50:56+02:00https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/5044Erreurs serveurs depuis le déploiement : MySQL server has gone away2022-06-29T13:50:56+02:00Mikaël SalsonErreurs serveurs depuis le déploiement : MySQL server has gone awayOn a une dizaine d'erreurs serveurs depuis le 18 juin.
Je n'ai pas investigué.
cc @duez @flothoniOn a une dizaine d'erreurs serveurs depuis le 18 juin.
Je n'ai pas investigué.
cc @duez @flothonihttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/4046Erreurs serveur : ValueError: invalid literal for long() with base 10: '[obje...2019-11-15T20:04:17+01:00Mikaël SalsonErreurs serveur : ValueError: invalid literal for long() with base 10: '[object Object]'Il y en a eu 14 depuis la mise à jour du serveur.
Voici le début de la traceback :
```
Traceback (most recent call last):
File "/usr/share/vidjil/server/web2py/gluon/restricted.py", line 219, in restricted
exec(ccode, environment)...Il y en a eu 14 depuis la mise à jour du serveur.
Voici le début de la traceback :
```
Traceback (most recent call last):
File "/usr/share/vidjil/server/web2py/gluon/restricted.py", line 219, in restricted
exec(ccode, environment)
File "/usr/share/vidjil/server/web2py/applications/vidjil/controllers/default.py", line 695, in <module>
File "/usr/share/vidjil/server/web2py/gluon/globals.py", line 421, in <lambda>
self._caller = lambda f: f()
File "/usr/share/vidjil/server/web2py/applications/vidjil/controllers/default.py", line 252, in get_data
).select(db.fused_file.ALL).first()
```https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/4044Le rapport monitor ne fonctionne plus2019-11-13T07:40:05+01:00Mikaël SalsonLe rapport monitor ne fonctionne plusExemple : http://app.vidjil.org/?set=25736&config=25&plot=v,j,plot
Remonté par ~"PRA-Prague"Exemple : http://app.vidjil.org/?set=25736&config=25&plot=v,j,plot
Remonté par ~"PRA-Prague"https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/3957Problème d'accès à Vidjil2019-08-20T19:55:04+02:00Anne de SeptenvilleProblème d'accès à VidjilBonjour,
Depuis hier fin d'après-midi, nous n'arrivons plus à accéder à https://app.vidjil.org/ (écran vide)
Je viens de tester ce matin https://rescue.vidjil.org/ et j'obtiens une erreur réseau.
Qu'en est-il de votre côté ?Bonjour,
Depuis hier fin d'après-midi, nous n'arrivons plus à accéder à https://app.vidjil.org/ (écran vide)
Je viens de tester ce matin https://rescue.vidjil.org/ et j'obtiens une erreur réseau.
Qu'en est-il de votre côté ?https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/3793A quoi sert la div data de la div liste2019-03-13T15:27:10+01:00Thonier FlorianA quoi sert la div data de la div listeIl semble que nous ayons en ce moment un souci avec la div data presente dans `list`. Je ne comprend pas à quoi elle sert.
~lille semble avoir un souci dans son rendu avec chrome. Elle prend toute la place. Il s'agit probablement d'une ...Il semble que nous ayons en ce moment un souci avec la div data presente dans `list`. Je ne comprend pas à quoi elle sert.
~lille semble avoir un souci dans son rendu avec chrome. Elle prend toute la place. Il s'agit probablement d'une erreur d'interpretation de règle CSS mais je n'arrive pas a reproduire le bug.
Cependant, dans mon cas, elle est toujours présente en fin de liste, mais toujours vide.
Peux-t-on envisager de la supprimer ou tout du moins de la mettre en hidden/dev tant qu'il n'y a pas d'informations à l'intérieur ?
cc @magiraud @mikael\-shttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/3289Un process peut se lancer avant son pre-process si R2 n'a pas fini d'être tél...2018-07-03T09:57:04+02:00Mikaël SalsonUn process peut se lancer avant son pre-process si R2 n'a pas fini d'être téléchargéCela reste encore une hypothèse mais qui explique bien ce qui est observé dans vdj#684.Cela reste encore une hypothèse mais qui explique bien ce qui est observé dans vdj#684.https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/3199Bug lors de l'ajout de samples à plusieurs patients2018-06-13T09:33:58+02:00Mikaël SalsonBug lors de l'ajout de samples à plusieurs patientsRapporté par ~"LIL-Lille" :
>Hier j’ai chargé 2 runs de 20 éch dans le cadre d’un test et en regardant ce matin, j’ai constaté tout de suite qu’il y a eu un souci : le patient qui contient le 1er échantillon a eu aussi tous les autres al...Rapporté par ~"LIL-Lille" :
>Hier j’ai chargé 2 runs de 20 éch dans le cadre d’un test et en regardant ce matin, j’ai constaté tout de suite qu’il y a eu un souci : le patient qui contient le 1er échantillon a eu aussi tous les autres alors que j’ai bien attribué un éch = un patient. En regardant au niveau du run, je me suis aperçue qu’il conservait l’historique des patients et donc incrémente à chaque fois la liste. J’ai mis une impression écran pour mieux me faire comprendre.
J'ai aussi essayé :
1. Création d'un run vide
2. Création de 4 patients vides
3. Upload de 4 samples dans le run en attribuant chaque sample à un seul patient
Le premier patient se retrouve avec les 4 samples, le 2è avec 3, le 3è avec 2 et le dernier avec 1.https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/3163Suite à un changement de format d'IMGT V-QUEST : il manque les % d'identité2018-04-17T14:52:41+02:00Mikaël SalsonSuite à un changement de format d'IMGT V-QUEST : il manque les % d'identitéLorsqu'on utilise la fonctionnalité « from IMGT ».
Important : utilisé pour le pronostic de la ~"bio-CLL"Lorsqu'on utilise la fonctionnalité « from IMGT ».
Important : utilisé pour le pronostic de la ~"bio-CLL"Mikaël SalsonMikaël Salsonhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2849Incident 2017-11-22 : Upload impossible ?2018-02-16T12:10:55+01:00Mathieu GiraudIncident 2017-11-22 : Upload impossible ?https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2795problème d'accès à vidjil ce matin.2017-11-16T10:19:34+01:00Ghost Userproblème d'accès à vidjil ce matin.app.vidjil.org et db.vidjil.prg semble inaccessible ce matin :
https://screenshots.firefox.com/4l0jDEyxuO6hIRAx/app.vidjil.org
![Capture_du_2017-11-16_09-19-49](/uploads/99d04d16f15b737e16c10eb2468c1b8b/Capture_du_2017-11-16_09-19-49.p...app.vidjil.org et db.vidjil.prg semble inaccessible ce matin :
https://screenshots.firefox.com/4l0jDEyxuO6hIRAx/app.vidjil.org
![Capture_du_2017-11-16_09-19-49](/uploads/99d04d16f15b737e16c10eb2468c1b8b/Capture_du_2017-11-16_09-19-49.png)
@magiraud @mikael-s @RyanHerbRyan HerbertRyan Herberthttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2346Incident 2017-04-08: vda inaccessible2017-05-22T15:25:32+02:00Mathieu GiraudIncident 2017-04-08: vda inaccessible(1:21) Moniteur perdu. Le ping répond, mais pas de ssh.
Dans ce genre de situation, contacte-t-on Cyrille directement ? A-t-on un moyen de mieux diagnostiquer sur l'interface openstack et/ou de la rebooter à distance ?
cc @mikael-s...(1:21) Moniteur perdu. Le ping répond, mais pas de ssh.
Dans ce genre de situation, contacte-t-on Cyrille directement ? A-t-on un moyen de mieux diagnostiquer sur l'interface openstack et/ou de la rebooter à distance ?
cc @mikael-s @RyanHerbhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2345vidjil n'est plus accessible2017-05-22T15:25:32+02:00Thonier Florianvidjil n'est plus accessibleIl semblerait que le site vidjil ne soit plus accessible.
On n'a plus accès à la page DB.
C'est le serveur qui a sauté ou une problème d'URL ?
Du coup, je me rend compte que dans ces cas là, on ne peux même pas mettre d'indication ...Il semblerait que le site vidjil ne soit plus accessible.
On n'a plus accès à la page DB.
C'est le serveur qui a sauté ou une problème d'URL ?
Du coup, je me rend compte que dans ces cas là, on ne peux même pas mettre d'indication sur la page d'acceuil non ?
@magiraud @mikael-s @RyanHerbMikaël SalsonMikaël Salsonhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2321Incident 2017-04-04: Tous les jobs sont en FAILED2017-05-22T15:25:32+02:00Mikaël SalsonIncident 2017-04-04: Tous les jobs sont en FAILEDMails de Jack (15:27) et Aurélie (15:22)
cc @magiraud @RyanHerb @flothoniMails de Jack (15:27) et Aurélie (15:22)
cc @magiraud @RyanHerb @flothonihttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2281La génération des rapports : erreur JS, bloquage sur "Generating reports"2017-05-22T15:25:32+02:00Mikaël SalsonLa génération des rapports : erreur JS, bloquage sur "Generating reports"http://app.vidjil.org/index.html?sample_set_id=23110&config=25
Générer un rapport : sa génération ne termine pas.
Erreurs JS :
```
TypeError: seg[5] is undefined
var seqV = seq.substring(0, seg['5']['stop'] + 1)
```
En rev...http://app.vidjil.org/index.html?sample_set_id=23110&config=25
Générer un rapport : sa génération ne termine pas.
Erreurs JS :
```
TypeError: seg[5] is undefined
var seqV = seq.substring(0, seg['5']['stop'] + 1)
```
En revanche hors ligne je n'ai pas de souci (mais c'est peut-être une question d'âge du fichier .vidjil…).
cc @magiraud @flothoni @RyanHerbWeb 2017.03https://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2280Erreur serveur quand on compare des échantillons2017-05-22T15:25:32+02:00Mikaël SalsonErreur serveur quand on compare des échantillonshttp://app.vidjil.org/?custom=22967&custom=22971&
cc @magiraud @RyanHerbhttp://app.vidjil.org/?custom=22967&custom=22971&
cc @magiraud @RyanHerbhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2265impossible de se connecter a app.vidjil.org2017-05-22T15:25:32+02:00Ghost Userimpossible de se connecter a app.vidjil.orgl'application vidjil ne charge pas . Aucun accès a la web app n'est possible. @magiraud @mikael-s @RyanHerbl'application vidjil ne charge pas . Aucun accès a la web app n'est possible. @magiraud @mikael-s @RyanHerbhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2260segmenter : fonction align indisponible2017-05-22T15:25:32+02:00Ghost Usersegmenter : fonction align indisponiblela fonction align du segmenter semble indisponible . elle renvoie le message d'erreur "cgi error : impossible to connect". @magiraud @mikael-sla fonction align du segmenter semble indisponible . elle renvoie le message d'erreur "cgi error : impossible to connect". @magiraud @mikael-shttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2226Open patient list ne fonctionne plus2017-05-22T15:25:32+02:00Mikaël SalsonOpen patient list ne fonctionne plusSur app, aller sur un patient et dans le menu `patients` cliquer sur `open patient list` → erreur 404 dans la console.
cc @magiraud @RyanHerbSur app, aller sur un patient et dans le menu `patients` cliquer sur `open patient list` → erreur 404 dans la console.
cc @magiraud @RyanHerbhttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2086Serveur anormalement lent2017-05-22T15:25:32+02:00Thonier FlorianServeur anormalement lentDemande de Patrick : Le serveur semble être très très lent.
Je viens de regarder pour m'y connecter et faire un petit test voir si le débit de mon côté était aussi impacté.
Le résultat est que les pages sont effectivement lentes à ch...Demande de Patrick : Le serveur semble être très très lent.
Je viens de regarder pour m'y connecter et faire un petit test voir si le débit de mon côté était aussi impacté.
Le résultat est que les pages sont effectivement lentes à chargées (de l'ordre de la minute pour ouvrir le page d'identification), on finit timeout majoritairement
Je ne vois pas de surplus au niveau de la charge de travail du serveur.
4 active worker, rien en attente ou en cours de run, charge moyenne en dessous des 1%.
L'espace disque est bon aussi.
Il y a bien quelques erreurs dans le log, mais rien qui ne me semble du genre a créer un tel dysfonctionnement (you do not have permission to launch process for this config, missing id, permission necessaire pour des suppression)
Il y a en revanche quelques erreurs propres à web2py (d'hier et du jour) mais je n'y ai pas accès, et les lenteurs remontent au début de semaine d'après Patrick.
Je ne sais pas si ça vient des processus vidjil ou de implémentation du serveur.
En tout cas, c'est assez urgent de régler le souci, mais je ne sais pas quoi faire de ces erreurs.
@RyanHerb @magiraud @mikael-shttps://gitlab.inria.fr/vidjil/vidjil/-/issues/2020Clone majoritaire qui disparait avec un nombre plus important de samples2019-08-20T10:34:34+02:00Vidjil TeamClone majoritaire qui disparait avec un nombre plus important de samplesExemple : Dans le deuxième il y a un clone très clair en TRG qui disparait dans le premier cas
http://rbx.vidjil.org/browser/?custom=16705&custom=16717&custom=16729&custom=16741&custom=16753&custom=16762&custom=16771&custom=16780&
http:...Exemple : Dans le deuxième il y a un clone très clair en TRG qui disparait dans le premier cas
http://rbx.vidjil.org/browser/?custom=16705&custom=16717&custom=16729&custom=16741&custom=16753&custom=16762&custom=16771&custom=16780&
http://rbx.vidjil.org/browser/?custom=16705&custom=16717&custom=16729&custom=16741&
***
Cela semble dépendant de l'ordre. Essayé en local : selon les fichiers mis en premier les résultats obtenus ne sont pas les mêmes…
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C'est ma faute : 0d40d04c7975403b691781b50eafef9efb1dced5
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Je ne suis pas sûr de comprendre, merci en tout cas d'avoir trouvé.
Proposition : dans l'urgence, reverter simplement ce commit plutôt que de chercher à corriger. Puis changer une batterie de tests et changer le fonctionnement de fuse.py tranquillement.
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Moi non plus je ne comprends pas.
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Ah, c'est plus embêtant... Peux-tu mettre un test quelque part, même très informel, où on voit ce qui ne va pas ?
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Commit réverté, utilisateur prévenu;
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Merci ! Est-ce que cela ne vaudrait pas le coup de faire une notification sur le serveur pour tous ?
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La mise à jour de prod-server sur rbx n'a été faite que hier et depuis il n'y a que Kiel qui a utilisé le fuse (ou lancé des jobs), du coup je ne pense pas que ce soit utile.
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ok, parfait
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@Duez @RyanHerb @mikael-s @magiraud