Attention une mise à jour du service Gitlab va être effectuée le mardi 30 novembre entre 17h30 et 18h00. Cette mise à jour va générer une interruption du service dont nous ne maîtrisons pas complètement la durée mais qui ne devrait pas excéder quelques minutes. Cette mise à jour intermédiaire en version 14.0.12 nous permettra de rapidement pouvoir mettre à votre disposition une version plus récente.

Commit f88ee197 authored by Mathieu Giraud's avatar Mathieu Giraud
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kmerstore.h: display message on stdout when using MapKmer

In fact, it could be faster to use MapKmer for very short sets of reads...
but Vidjil focuses on HTS datasets.
parent a1a73780
......@@ -346,6 +346,7 @@ IKmerStore<T> *KmerStoreFactory::createIndex(string seed, bool revcomp) {
try{
index = new ArrayKmerStore<T>(seed, revcomp);
}catch(exception e){
cout << " (using a MapKmer to fit into memory)" << endl;
index = new MapKmerStore<T>(seed, revcomp);
}
return index;
......
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