Attention une mise à jour du service Gitlab va être effectuée le mardi 30 novembre entre 17h30 et 18h00. Cette mise à jour va générer une interruption du service dont nous ne maîtrisons pas complètement la durée mais qui ne devrait pas excéder quelques minutes. Cette mise à jour intermédiaire en version 14.0.12 nous permettra de rapidement pouvoir mettre à votre disposition une version plus récente.

Commit 1fc339c7 authored by Mathieu Giraud's avatar Mathieu Giraud
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js/clone.js: GC content

parent 66e87171
......@@ -42,6 +42,7 @@ function Clone(data, model, hash) {
this.m.clusters[hash]=[hash]
this.m.clones[hash]=this
this.tag = this.getTag();
this.computeGCContent()
}
......@@ -337,6 +338,28 @@ Clone.prototype = {
}
},
computeGCContent: function () {
if (typeof (this.sequence) == 'undefined') {
this.GCContent = '?'
return
}
var gc = 0
for (var i in this.sequence) {
if ("GgCc".indexOf(this.sequence[i]) > -1)
gc++ }
this.GCContent = 100 * gc / this.sequence.length
},
getGCContent : function () {
if (typeof (this.GCContent) != 'undefined'){
return this.GCContent
}else{
return 0;
}
},
getSequenceLength : function () {
if (typeof (this.sequence) != 'undefined' && this.sequence != 0){
return this.sequence.length
......
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