Attention une mise à jour du service Gitlab va être effectuée le mardi 30 novembre entre 17h30 et 18h00. Cette mise à jour va générer une interruption du service dont nous ne maîtrisons pas complètement la durée mais qui ne devrait pas excéder quelques minutes. Cette mise à jour intermédiaire en version 14.0.12 nous permettra de rapidement pouvoir mettre à votre disposition une version plus récente.

Commit 025efba7 authored by Mathieu Giraud's avatar Mathieu Giraud
Browse files

vidjil.cpp: CLI11, there can be several '-g'

parent 2da8ef93
......@@ -331,7 +331,7 @@ int main (int argc, char **argv)
-g <path>
multiple locus/germlines, shortcut for '-g <path>/)Z" DEFAULT_MULTI_GERMLINE_FILE R"Z(',
processes human TRA, TRB, TRG, TRD, IGH, IGK and IGL locus, possibly with some incomplete/unusal recombination
)Z") -> group(group) -> expected(1) -> set_type_name("GERMLINES");
)Z") -> group(group) -> set_type_name("GERMLINES");
app.add_option("-V", v_reps_V, "custom V germline multi-fasta file") -> group(group) -> set_type_name("FILE");
app.add_option("-D", v_reps_D, "custom D germline multi-fasta file (and resets -m and -w options), will segment into V(D)J components") -> group(group) -> set_type_name("FILE");
......
Markdown is supported
0% or .
You are about to add 0 people to the discussion. Proceed with caution.
Finish editing this message first!
Please register or to comment