Attention une mise à jour du service Gitlab va être effectuée le mardi 30 novembre entre 17h30 et 18h00. Cette mise à jour va générer une interruption du service dont nous ne maîtrisons pas complètement la durée mais qui ne devrait pas excéder quelques minutes. Cette mise à jour intermédiaire en version 14.0.12 nous permettra de rapidement pouvoir mettre à votre disposition une version plus récente.

Commit 3b90dbf7 authored by FAGES Francois's avatar FAGES Francois
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grrrr

parent 5e4ba131
......@@ -4,7 +4,9 @@
list_ODE/0,
compute_ode/0,
ode/2,
load_ode/1
% export_ode/1,
load_ode/1,
add_ode/1
]).
:- dynamic(ode/2).
......@@ -13,7 +15,8 @@ list_ODE :-
biocham_command,
doc('
returns the set of ordinary differential equations
and initial concentrations (one line per molecule).
and initial concentrations (one line per molecule)
associated to the current model
\\begin{example}
'),
biocham_silent(clear_model),
......@@ -81,6 +84,20 @@ print_ode :-
)
).
%export_ode(OutputFile) :-
% biocham_command,
% type(OutputFile, output_file),
% doc('
% exports the current Biocham model (reaction rules, initial state, parameters and
% macros) in an xppaut .ode file.
% '),
% automatic_suffix(OutputFile, '.ode', write, FilenameODE),
% setup_call_cleanup(
% open(FilenameODE, write, Stream),
% export_ode_stream(Stream),
% close(Stream)
% ).
load_ode(InputFile) :-
biocham_command,
......
......@@ -22,20 +22,20 @@
** Numerical temporal properties
* Commands at Top-level
- toplevel.pl
** Loading, listing and exporting models
** Loading, listing, importing and exporting models
*** Biocham files
- models.pl
*** SBML files
- sbml_files.pl
*** ODE files
- ODEfunction.pl
- ode.pl
- odefunction.pl
*** Graphics files
*** Other files
- nusmv.pl
** Listing and editing reactions and events
*** Reactions
- reaction_editor.pl
- ode.pl
*** Events
- events.pl
** Listing and defining initial states, molecules and locations
......
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