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% Context encoding

dyliss(lucas,clemence,(asp;metabolisme;graphe)).
dyliss(lucas,meziane,(asp;metabolisme)).
dyliss(lucas,nathalie,(tgfbeta;graphe_interaction;fca)).
dyliss(lucas,jacques,(asp;classification;optimisation;puceron;tgfbeta;graphe_interaction;fca)).
dyliss(lucas,denis,(puceron;graphe_interaction;classification;fca)).
dyliss(jacques,denis,(puceron;graphe_interaction;classification;fca)).
dyliss(lucas,olivier_dameron,(rdf;asp;python)).
dyliss(lucas,julie_laniau,asp).
dyliss(jeremy,lucas,fca).
dyliss(lucas,(sebastien_letord;sebastien_francois;meziane;pierre_vignet;jeremy),python).
dyliss(clemence,olivier_dameron,askomics).
dyliss(marie,jeanne,metabolisme).
dyliss(meziane,(arnaud;clemence;marie;jeanne),(metabolisme;biologie_marine)).
dyliss(meziane,(pierre_vignet;lucas),(python;asp)).
dyliss((olivier_dameron;meziane;xavier),(olivier_dameron;meziane;xavier),askomics).
dyliss(jeanne,francois_coste,classification).
dyliss(xavier,(meziane;marine;francois_coste;olivier_dameron),askomics).

dyliss(nathalie,(jacques;lucas),(fca;asp;graphe;tgfbeta)).
dyliss(nathalie,(pierre_vignet;olivier_dameron),(biopax;metabolisme;rdf)).
dyliss(nathalie,catherine,tf).
dyliss(nathalie,francois_coste,(signalisation;proteine)).
dyliss(nathalie,maxime,(graphe;biopax;tgfbeta)).
dyliss(nathalie,pierre_vignet,(signalisation;optimisation)).
dyliss(francois_moreews,catherine,(tf;orthocis;orthology)).
dyliss(francois_moreews,olivier_dameron,(biopax;askomics)).
dyliss(francois_moreews,anne,graphe).

dyliss(olivier_dameron,francois_coste,(correlation;gene_ontology)).
dyliss(olivier_dameron,denis,askomics).
dyliss(olivier_dameron,jacques,asp).
dyliss(olivier_dameron,anne,(metabolisme;signature;asp;askomics;rdf)).
dyliss(olivier_dameron,nathalie,(signalisation;matrice_extracell)).
dyliss(olivier_dameron,jeanne,rdf).
dyliss(olivier_dameron,francois_moreews,(biopax;rdf;fair_data)).
dyliss(olivier_dameron,denis,askomics).

dyliss(olivier_dameron,lucas,(asp;graphe)).
dyliss(olivier_dameron,(meziane;xavier),(rdf;sparql)).
dyliss(olivier_dameron,pierre_vignet,biopax).
dyliss(olivier_dameron,vijay,(sparql;requete_federe)).
dyliss(olivier_dameron,(marine;meline),askomics).
dyliss(olivier_dameron,meline,(graphe;correlation)).


dyliss(marie, olivier_dameron, metabolisme).
dyliss(marie, anne, metabolisme).
dyliss(marie, anne, bacterie).
dyliss(marie, anne, graphe_interaction).
dyliss(marie, anne, ecologie_des_systemes).
dyliss(marie, nathalie, ecologie_des_systemes).
dyliss(marie, jeanne, metabolisme).
dyliss(marie, jeanne, bacterie).

% % dyliss(marie, jeremie, metabolisme).
% % dyliss(marie, jeremie, ecologie des systemes).
% % dyliss(marie, damien, metabolisme).
% % dyliss(marie, damien, graphe_interaction).
% % dyliss(marie, damien, bacterie).
% % dyliss(marie, damien, ecologie des systemes).
dyliss(marie, denis, ecologie_des_systemes).
dyliss(marie, clemence, metabolisme).
dyliss(marie, clemence, bacterie).
dyliss(marie, clemence, graphe_interaction).
dyliss(marie, clemence, ecologie_des_systemes).
dyliss(marie, julie, metabolisme).
dyliss(marie, julie, graphe_interaction).
dyliss(marie, meziane, metabolisme).
dyliss(marie, meziane, bacterie).
dyliss(marie, meziane, graphe_interaction).
dyliss(marie, meziane, ecologie_des_systemes).
dyliss(marie, camille, metabolisme).
dyliss(marie, camille, bacterie).
dyliss(marie, camille, graphe_interaction).
dyliss(marie, pierre, metabolisme).

dyliss(francois_coste,juliette,(correlations;grammaires;proteine;enzymes;transporteurs;apprentissage)).
dyliss(francois_coste,arnaud,(plma;enzymes;visu3D;classification)).
dyliss(francois_coste,clemence,transporteurs).
dyliss(francois_coste,jeanne,enzymes).
dyliss(francois_coste,catherine,grammaires).
dyliss(francois_coste,olivier_dameron,gene_ontology).
dyliss(francois_coste,nathalie,adam).
% % dyliss(francois_coste,_,python).

% dyliss(maxime,(nathalie;anne),(biopax;tgfbeta;graphe)).
% dyliss(maxime,pierre_vignet,biopax).
% dyliss(maxime,clemence,(asp;metabolisme;interpretation_abstraite;optimisation)).


% dyliss(mael,arnaud,(python;java)).
% dyliss(mael,arnaud,meziane,(biologie_marine;metabolisme)).
% dyliss(mael,anne,nathalie,(graphe;enzymes;metabolisme)).
% dyliss(mael,anne,nathalie,expression).
% dyliss(mael,anne,xavier,askomics).

% dyliss(juliette,arnaud,(visu3D;alignement)).
% dyliss(juliette,meline,r).

% dyliss(meline,anne,olivier_dameron,(signature;sante;graphe;fca)).
% dyliss(marine,anne,olivier_dameron,(tf;askomics)).

% dyliss(arnaud,(anne;jeanne;jacques;francois_coste;juliette),classification).
% dyliss(arnaud,(anne;meziane;clemence;jeanne),(metabolisme;algue)).
% dyliss(arnaud,anne,jacques,asp).
% dyliss(arnaud,mael,(biologie_marine;metabolisme)).
% dyliss(catherine,catherine,arn).


% undirected graph.
dyliss(A,B,S):- dyliss(B,A,S).

% triplets of human
dyliss(A,B,S):- dyliss(A,B,_,S).
dyliss(A,C,S):- dyliss(A,_,C,S).
dyliss(B,C,S):- dyliss(_,B,C,S).

% implications.
dyliss(A,B,rdf):- dyliss(A,B,sparql).

% every humans.
human(A):- dyliss(A,_,_).


% subjects for particular human.
% sujet(lucas,(asp;classification;optimisation;graphe_interaction;fca;python)).




%relations entre mots-cles
subject_implication(techno,(python;docker;visualisation;sparql;asp;java)).
subject_implication(application,(puceron;biologie_marine;microbiologie;tgfbeta;adam)).
subject_implication(reseau,(metabolisme;signalisation;regulation;modelisation;graphe;identification_reseau)).
subject_implication(modelisation,(biopax;asp;abstraction;rdf)).
subject_implication(graphe,(compression;biomarqueur;controleurs;signature;abstraction)).
subject_implication(signalisation,(controleur;comparaison)).
subject_implication(asp,(opt_combinatoire;hybride)).
subject_implication(metabolisme,(reconstruction;annotation;comparaison;graphe;enzymes;transporteurs)).
subject_implication(regulation,(graphe;tfbs;non_codant;orthologie;annotation)).
subject_implication(proteines,(identification_prot;classification_famille_prot;annotation;transporteurs;enzymes)).
subject_implication(requete,(rdf;biopax;sparql;construction;performance)).
subject_implication(classification,(fca;signature)).

link(A,B):- subject_implication(A,B).

















% Context encoding

dyliss(lucas,clemence,(asp;metabolisme;graphe)).
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dyliss(marie, julie, graphe_interaction).
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dyliss(marie, camille, metabolisme).
dyliss(marie, camille, bacterie).
dyliss(marie, camille, graphe_interaction).
dyliss(marie, pierre, metabolisme).

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dyliss(francois_coste,jeanne,enzymes).
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% undirected graph.
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% triplets of human
dyliss(A,B,S):- dyliss(A,B,_,S).
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% implications.
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% every humans.
human(A):- dyliss(A,_,_).


% subjects for particular human.
% sujet(lucas,(asp;classification;optimisation;graphe_interaction;fca;python)).




%relations entre mots-cles
subject_implication(techno,(python;docker;visualisation;sparql;asp;java)).
subject_implication(application,(puceron;biologie_marine;microbiologie;tgfbeta;adam)).
subject_implication(reseau,(metabolisme;signalisation;regulation;modelisation;graphe;identification_reseau)).
subject_implication(modelisation,(biopax;asp;abstraction;rdf)).
subject_implication(graphe,(compression;biomarqueur;controleurs;signature;abstraction)).
subject_implication(signalisation,(controleur;comparaison)).
subject_implication(asp,(opt_combinatoire;hybride)).
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subject_implication(classification,(fca;signature)).