#880 Poromechanics: add the vertex matching init objects in the input parameter file.

Data/Interpolation/Poromechanics/Identity_2.hhdata

+# Vertex index in mesh 1 / vertex index in mesh 2
+1 1
+2 2
+3 3
+4 4
+5 5
+6 6
+7 7
+8 8
+9 9

Data/Interpolation/Poromechanics/Identity_3.hhdata

+# Vertex index in mesh 1 / vertex index in mesh 2
+1 1
+2 2
+3 3
+4 4
+5 5
+6 6
+7 7
+8 8
+9 9
+10 10
+11 11
+12 12
+13 13
+14 14
+15 15
+16 16

Data/Interpolation/Poromechanics/Identity_5.hhdata

+# Vertex index in mesh 1 / vertex index in mesh 2
+1 1
+2 2
+3 3
+4 4
+5 5
+6 6
+7 7
+8 8
+9 9
+10 10
+11 11
+12 12
+13 13
+14 14
+15 15
+16 16
+17 17
+18 18
+19 19
+20 20
+21 21
+22 22
+23 23
+24 24
+25 25
+26 26
+27 27
+28 28
+29 29
+30 30
+31 31
+32 32
+33 33
+34 34
+35 35
+36 36

Data/Interpolation/Poromechanics/Identity_8.hhdata

+# Vertex index in mesh 1 / vertex index in mesh 2
+1 1
+2 2
+3 3
+4 4
+5 5
+6 6
+7 7
+8 8
+9 9
+10 10
+11 11
+12 12
+13 13
+14 14
+15 15
+16 16
+17 17
+18 18
+19 19
+20 20
+21 21
+22 22
+23 23
+24 24
+25 25
+26 26
+27 27
+28 28
+29 29
+30 30
+31 31
+32 32
+33 33
+34 34
+35 35
+36 36
+37 37
+38 38
+39 39
+40 40
+41 41
+42 42
+43 43
+44 44
+45 45
+46 46
+47 47
+48 48
+49 49
+50 50
+51 51
+52 52
+53 53
+54 54
+55 55
+56 56
+57 57
+58 58
+59 59
+60 60
+61 61
+62 62
+63 63
+64 64
+65 65
+66 66
+67 67
+68 68
+69 69
+70 70
+71 71
+72 72
+73 73
+74 74
+75 75
+76 76
+77 77
+78 78
+79 79
+80 80
+81 81

Data/Lua/demo_input_poromechanics.lua

@@ -1242,5 +1242,33 @@ TransientSource1 = {
 porosity = 0.1
 
 
+-- Fluid
+InitVertexMatchingInterpolator10 = {
+    
+    -- Finite element space for which the dofs index will be associated to each vertex.
+    -- Expected format: VALUE
+    finite_element_space = 10,
+    
+    -- Numbering subsetfor which the dofs index will be associated to each vertex.
+    -- Expected format: "VALUE"
+    numbering_subset = 13
+    
+} -- InitVertexMatchingInterpolator10
+
+
+-- Solid
+InitVertexMatchingInterpolator20 = {
+    
+    -- Finite element space for which the dofs index will be associated to each vertex.
+    -- Expected format: VALUE
+    finite_element_space = 20,
+    
+    -- Numbering subsetfor which the dofs index will be associated to each vertex.
+    -- Expected format: "VALUE"
+    numbering_subset = 22
+    
+} -- InitVertexMatchingInterpolator20
+
+interpolation_file = "${HOME}/Codes/HappyHeart/Data/Interpolation/Poromechanics/Identity_2.hhdata"
 
 

Data/Mesh/poromechanics.mesh

-MeshVersionFormatted 2
-
-Dimension
-2
-
-Vertices
-49
-0 0 4
-0.00166666666667 0 1
-0.00333333333333 0 1
-0.005 0 1
-0.00666666666667 0 1
-0.00833333333333 0 1
-0.01 0 2
-0 0.00166666666667 4
-0.00166666666667 0.00166666666667 0
-0.00333333333333 0.00166666666667 0
-0.005 0.00166666666667 0
-0.00666666666667 0.00166666666667 0
-0.00833333333333 0.00166666666667 0
-0.01 0.00166666666667 2
-0 0.00333333333333 4
-0.00166666666667 0.00333333333333 0
-0.00333333333333 0.00333333333333 0
-0.005 0.00333333333333 0
-0.00666666666667 0.00333333333333 0
-0.00833333333333 0.00333333333333 0
-0.01 0.00333333333333 2
-0 0.005 4
-0.00166666666667 0.005 0
-0.00333333333333 0.005 0
-0.005 0.005 0
-0.00666666666667 0.005 0
-0.00833333333333 0.005 0
-0.01 0.005 2
-0 0.00666666666667 4
-0.00166666666667 0.00666666666667 0
-0.00333333333333 0.00666666666667 0
-0.005 0.00666666666667 0
-0.00666666666667 0.00666666666667 0
-0.00833333333333 0.00666666666667 0
-0.01 0.00666666666667 2
-0 0.00833333333333 4
-0.00166666666667 0.00833333333333 0
-0.00333333333333 0.00833333333333 0
-0.005 0.00833333333333 0
-0.00666666666667 0.00833333333333 0
-0.00833333333333 0.00833333333333 0
-0.01 0.00833333333333 2
-0 0.01 4
-0.00166666666667 0.01 3
-0.00333333333333 0.01 3
-0.005 0.01 3
-0.00666666666667 0.01 3
-0.00833333333333 0.01 3
-0.01 0.01 3
-
-Edges
-24
-1 2 1
-2 3 1
-3 4 1
-4 5 1
-5 6 1
-6 7 1
-7 14 2
-14 21 2
-21 28 2
-28 35 2
-35 42 2
-42 49 2
-44 43 3
-45 44 3
-46 45 3
-47 46 3
-48 47 3
-49 48 3
-8 1 4
-15 8 4
-22 15 4
-29 22 4
-36 29 4
-43 36 4
-
-Triangles
-72
-1 2 9 0
-1 9 8 0
-2 3 10 0
-2 10 9 0
-3 4 11 0
-3 11 10 0
-4 5 12 0
-4 12 11 0
-5 6 13 0
-5 13 12 0
-6 7 14 0
-6 14 13 0
-8 9 16 0
-8 16 15 0
-9 10 17 0
-9 17 16 0
-10 11 18 0
-10 18 17 0
-11 12 19 0
-11 19 18 0
-12 13 20 0
-12 20 19 0
-13 14 21 0
-13 21 20 0
-15 16 23 0
-15 23 22 0
-16 17 24 0
-16 24 23 0
-17 18 25 0
-17 25 24 0
-18 19 26 0
-18 26 25 0
-19 20 27 0
-19 27 26 0
-20 21 28 0
-20 28 27 0
-22 23 30 0
-22 30 29 0
-23 24 31 0
-23 31 30 0
-24 25 32 0
-24 32 31 0
-25 26 33 0
-25 33 32 0
-26 27 34 0
-26 34 33 0
-27 28 35 0
-27 35 34 0
-29 30 37 0
-29 37 36 0
-30 31 38 0
-30 38 37 0
-31 32 39 0
-31 39 38 0
-32 33 40 0
-32 40 39 0
-33 34 41 0
-33 41 40 0
-34 35 42 0
-34 42 41 0
-36 37 44 0
-36 44 43 0
-37 38 45 0
-37 45 44 0
-38 39 46 0
-38 46 45 0
-39 40 47 0
-39 47 46 0
-40 41 48 0
-40 48 47 0
-41 42 49 0
-41 49 48 0
-
-End

Sources/ModelInstances/UnderDevelopment/Poromechanics/InputParameterList.hpp

@@ -120,8 +120,8 @@ namespace HappyHeart
             fluid = 10,
             solid = 20
         };
-
-        
+            
+             
         using InputParameterTuple = std::tuple
         <
             InputParameter::TimeManager,
@@ -175,7 +175,13 @@ namespace HappyHeart
         
             InputParameter::PoromechanicsNS::BulkSolid,
             
-            InputParameter::TransientSource<EnumUnderlyingType(SourceIndex::inlet_pressure)>
+            InputParameter::TransientSource<EnumUnderlyingType(SourceIndex::inlet_pressure)>,
+            
+            InputParameter::InterpolationFile,
+            
+            InputParameter::InitVertexMatchingInterpolator<EnumUnderlyingType(InitVertexMatchingInterpolator::solid)>,
+            InputParameter::InitVertexMatchingInterpolator<EnumUnderlyingType(InitVertexMatchingInterpolator::fluid)>
+
         >;
         
 

Sources/ModelInstances/UnderDevelopment/Poromechanics/ModelInitialize.hxx

@@ -193,7 +193,8 @@ namespace HappyHeart
                 const auto& porosity_varf = GetPorosityVariationalFormulation();
                 
                 porosity_param_ =
-                    std::make_unique<Private::PorosityParameter>(porosity_varf.GetSystemSolution(porosity_varf.GetNumberingSubset()));
+                    std::make_unique<Private::PorosityParameter>(porosity_varf.GetSystemSolution(porosity_varf.GetNumberingSubset()),
+                                                                 input_parameter_data);
             }
         }
         

Sources/ModelInstances/UnderDevelopment/Poromechanics/Private/PorosityParameter.cpp

@@ -9,6 +9,7 @@
 //
 
 #include "FiniteElement/FiniteElementSpace/GodOfDofManager.hpp"
+#include "FiniteElement/FiniteElementSpace/Private/DofProgramWiseIndexListPerVertexCoordIndexManager.hpp"
 
 #include "ModelInstances/UnderDevelopment/Poromechanics/Private/PorosityParameter.hpp"
 #include "ModelInstances/UnderDevelopment/Poromechanics/InputParameterList.hpp"
@@ -26,7 +27,8 @@ namespace HappyHeart
         {
             
             
-            PorosityParameter::PorosityParameter(const GlobalVector& solution_porosity_varf)
+            PorosityParameter::PorosityParameter(const GlobalVector& solution_porosity_varf,
+                                                 const InputParameterList& input_parameter_data)
             : solution_porosity_varf_(solution_porosity_varf)
             {
                 decltype(auto) god_of_dof_manager = GodOfDofManager::GetInstance();
@@ -88,6 +90,19 @@ namespace HappyHeart
                     
                 }
                 
+                {
+                    using type = NonConformInterpolatorNS::FromVertexMatching;
+                    
+                    auto& init_vertex_matching_manager =
+                        ::HappyHeart::Private::DofProgramWiseIndexListPerVertexCoordIndexManager::GetInstance();
+                    
+                    from_solid_to_fluid_ =
+                        std::make_unique<type>(input_parameter_data,
+                                               init_vertex_matching_manager.GetDofProgramWiseIndexListPerVertexCoordIndex(EnumUnderlyingType(InitVertexMatchingInterpolator::solid)),
+                                               init_vertex_matching_manager.GetDofProgramWiseIndexListPerVertexCoordIndex(EnumUnderlyingType(InitVertexMatchingInterpolator::fluid)));
+                    
+                }
+                
             }
             
             

Sources/ModelInstances/UnderDevelopment/Poromechanics/Private/PorosityParameter.hpp

@@ -16,6 +16,10 @@
 
 # include "Parameters/ParameterAtDof.hpp"
 
+# include "Operators/NonConformInterpolator/FromVertexMatching.hpp"
+
+# include "ModelInstances/UnderDevelopment/Poromechanics/InputParameterList.hpp"
+
 
 namespace HappyHeart
 {
@@ -24,7 +28,7 @@ namespace HappyHeart
     namespace PoromechanicsNS
     {
         
-        
+
         namespace Private
         {
             
@@ -58,9 +62,10 @@ namespace HappyHeart
                  * \brief Constructor.
                  *
                  * \param[in] solution_porosity_varf Solution of the  PorosityVariationalFormulation.
-                 *
+                 * \copydetails doxygen_hide_input_parameter_data_arg
                  */
-                explicit PorosityParameter(const GlobalVector& solution_porosity_varf);
+                explicit PorosityParameter(const GlobalVector& solution_porosity_varf,                                           
+                                           const InputParameterList& input_parameter_data);
                 
                 //! Destructor.
                 ~PorosityParameter() = default;
@@ -164,6 +169,9 @@ namespace HappyHeart
                 //! Underlying global vector for porosity on fluid mesh from previous time iteration.
                 GlobalVector::unique_ptr on_fluid_mesh_vector_previous_time_iteration_ = nullptr;
                 
+                //! Interpolator to transform porosity from solid \a GodOfDof to the fluid one.
+                NonConformInterpolatorNS::FromVertexMatching::unique_ptr from_solid_to_fluid_ = nullptr;
+                
             };